内心のことは秀吉に直接聞いてみないと確かめようがないですが、たぶん、なかったと思います。
秀吉は低い身分から急激に出世したため、譜代の家臣というものがいません。自分が取り立てて大名にしてやった加藤や福島は、頼れる同志とは違います。
誰も信じる者がいない、というのは辛いものです。だから唯一、若い頃からの親友であった前田利家だけは、何があっても味方だ、と信じるのは、一種の心の支えになっていたのではないかな、と思います。
仮に晩年に「俺の死後に、こいつは自分が天下を取ろうという気を起こすんじゃないか」という疑念がよぎったとしても、利家を殺しちゃったら、もう、本気で信じる者は一人もいない、という無間地獄のような状態で死ななければならない。それは嫌でしょう、秀吉ってけっこうナイーブな人間ですから。