つい先日、似たようなことがあったので、再度書いておきたいと思います。
それは、とある研究会でのこと。
通常、質量分析関連企業の方が研究会等でお話しされる時は、営業の方であれば製品紹介が中心、アプリケーション開発担当の方であれば自社製品を使ったアプリケーションデータの紹介が中心になります。
しかしその時、その質量分析関連企業のアプリケーション開発担当の方（私は以前から面識があります）は、LC/MSの基礎的な内容について話されていました。それはそれで、参加者にとってはとても有益だと思うのですが、その内容について幾つか（？）と思うことがあったので、紹介しておきます。
１．分子（イオン）を識別することで分子量情報が得られる？
⇒ これについては誤解されている方が多いのですが、通常低分子化合物を測定したマススペクトル上のイオンのm/z 値から得られるのは、“分子量” 情報ではなく“分子の質量”情報です。これについては、バイオマーケットjpの質量分析屋のネタ帳というコラムに書いていますので、参考にしてください。
２．マススペクトルの同位体ピーク強度比が正しくない
⇒ ある化合物のマススペクトル（モノアイソトピックピークおよび同位体ピーク付近の拡大）を示されていましたが、同位体ピークのパターンが、その化合物の元素組成から計算されるパターンとかなり異なっていました。特に、13Cを1つ含む同位体ピークの相対強度は50%程度誤差がありました。また、この化合物は塩素を1つ含むのですが、その酸化体が不純物として観測されていて、その不純物のモノアイソトピックピークおよび同位体ピークのパターンが、塩素を1つ含むには＋2の同位体ピークの相対強度が小さすぎました。
この後の説明で、イオンの精密質量から構成元素を推測する時に、同位体ピークのパターンが役に立つという説明をされていただけに、プレゼンに使うデータに気を使っておられなかったことが非常に残念でした。
細かい話かも知れませんが、専門家であれば、用語1つあるいはデータ1つにまで拘るという気配りが必要だと思います。
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引用元：研究会でのLC/MS基礎に関するプレゼンを聴いて