これは完全に意味で使い分けるパターンのものです。
「現在」の意味のときは漢字で「今」、「もう」という意味のときは平仮名で「いま」となります。
例）あの人が今では押しも押されぬ有名人になったなんて。
着席のまま、いましばらくお待ちください。
ただし、「現在」の意味のときでも、「ただいま」というときは平仮名表記になります。
あと、「いまだ」（漢字で書くとすれば「未だ」も平仮名になります。
例）いまだかつてそのようなことが行われたことはない。
これは私だけかもしれませんけれども、通常の「今」と「いま」の使い分けは比較的すぐ覚えたのですが、「今や」とこんがらがって平仮名なのか漢字表記なのかわからなくなってしまうことがあります。
やはり丁寧に用字用例辞典を確認しつつ、作業を行うことが大事です。