Binding of Isaacのボスは中ボス含めて90種類いる。ちなみに敵は197種類いる。敵の種類の約二分の一と言う比率は他にはないのではないかというぐらいボスが多いのだが、それもマップがランダムなローグライグゲームならではの特色と言える。
本記事ではそのボスの解説を作者的な基準で雑魚から順番に紹介していきたいと思う。非常に多いので４つに記事を分ける。
目次：
10~1位←現在
注意：
・天使２体以外の中ボスは、ボスラッシュにも登場せずHPが非常に低いので除外している。
・Mom's Heart と It Lives はほとんど変わらないので一つとした。
・出現場所はボスステージのみ記載する。「x2」はDouble Troble(2体いる)ということである。
・特定の条件のボスを除いて、Afterbirthのボスは???を３つの異なるキャラクターで、Afterbirth+のボスは???を６つの異なるキャラクターで倒すことでアンロックされる。
・ランキングの基準は筆者のプレイ感に基づく総合評価的な独断である。以下の考えがある。
①ボスの攻撃パターンはほとんどの場合シンプルなのでHPが高くても低くても時間がちょっと長くなるくらいであまり難易度に影響を与えない。（Mega FattyやThe Cageのように妙に高い場合は除く）
①雑魚敵召喚より弾の方が無効化しにくいので難しい。
②弾幕よりも体当たりの方が避けるのが難しい。
③Chaos CardやPlan CやThe Bibleなどの即死アイテム、PyromaniacやHost Hat、The Soulなど攻撃の大半を無力化するアイテム、Gnowed Leafと自動攻撃アイテムの組み合わせによる無敵攻撃、Stop Watchや「I'm Drowshy」ピルなどによる無限遅延効果など、あまりに強力なアイテムはどのボスに対しても勝てるのでランキングに影響を与えないものとする。
＊
10.??? (Blue Baby)
出現ステージ：The Chest
HP：2000
関連ボス：Isaac, Hush
The Polaroidを持ってCathedralをクリアすることでいけるステージThe Chestのボス。プレイできるキャラクター「???」と同じである。
一応PolaroidルートのラスボスなのだがThe Chestが難し過ぎて敵の方が強いなどと言われる不名誉なボス。しかもThe Chestは大量にアイテムを取得できるのでこのボスの持つ戦略性に気づかずに殺せてしまうことがしばしばある。
ホーミング弾と、大量のダメージ防御を召喚する攻撃パターンをもつ。貫通弾を持っていると苦労しない。が、それゆえに装備状況によっては結構強いボスでもある（特に目隠しされているチャレンジ27:BRAINS!とか）。
???は３つのフェーズを持つ。
１
・寝ている。こちらが攻撃するまで攻撃を開始しない＝リモコン爆弾の複数設置をすることで最初の一撃での大ダメージを与えることが可能。
・ランダムなタイミングでisaacに分裂した弾を打つ。ホーミング弾になることがある。
・isaacに１発打つ。
・速いカーブする涙の弾幕あるいは８方向の涙の弾幕
２
・立ち上がる。無敵ハエが現れ???を護衛する。
・ランダムなタイミングでisaacに分裂した弾を打つ。ホーミング弾になることがある。
・isaacに１、２発打つ。
・速いカーブする涙の弾幕
・ハエ系の敵を召喚する。ハエたちは???の周りを旋回する。
・いびつなX型の４方向ホーミング弾、あるいは８方向のホーミング弾を出す。８方向は少々避けにくい。
３
・飛んで移動する。
・ランダムなタイミングでisaacに分裂した弾を打つ。ホーミング弾になることがある。
・isaacに１、２発打つ。
・速いカーブする涙の弾幕
・より蝿を召喚する。
・テレポートする。テレポートされた際に旋回していた蝿は解放されisaacにまっすぐ襲撃する。Stop Watchなどで速度が遅くなってる時はテレポートできない。
数少ない笑顔で死ぬボス。
9.Mom's Heart / It Lives
/ 
出現ステージ：The Womb(8F), Utero(8F), Scarred Womb(8F)
HP：いずれも950
子宮ステージの大ボス。先に進むにはここで１０回以上クリアしないといけないので嫌という程お目にかかれるであろう。
非常に多様な弾幕を出し、時々敵を召喚して上に上がりダメージを受け付けなくなり敵が全滅するのを待つ、と言う攻撃パターンを持つ。その際も弾を出し続けているが彼女の弾は敵にダメージを与えるのでほっといても敵が全滅する事はある。
HPが少なくなると一切の攻撃をやめて４方向のブリムストーンレーザーを高速で回転する。避けるのがシビアだがダメージチャンスの塊でもある。
弾幕の角度が細かいので遠距離戦がおすすめである。近距離の場合は弾を発してない時、およびに広角の攻撃の時が安全である。The Souls取得時はほとんど弾幕は命中しない。
Mom's HeartとIt Livesの違いは召喚する敵であり、It Livesはボスを召喚することがある。が、自ら発した弾幕でそのボスをすぐに殺してしまうことがしばしば。
死ぬときに最後弾をだして死ぬので油断大敵。
アイテムの聖書を使うと瞬時に殺せる。
8.Isaac
出現ステージ：The Catedral
HP：2000
関連ボス：???
雑魚頼りの死にかけの？？？とは異なり凶暴なポテンシャルを見せてくれるIsaac先輩。
攻撃のほとんどが激しい弾幕なのでコツを掴むまで死にまくると思われる。遠距離が基本的に安全だし、近距離の場合は弾を出してない隙を狙うしかない。
???同様、フェーズが３つある。
１
・寝ている。こちらが攻撃するまで攻撃を開始しない＝リモコン爆弾の複数設置などで最初の一撃で大ダメージを与えることが可能。
・１２方向弾幕、スピンする８方向の弾幕、スピンと直線を両方とも行う８方向の弾幕
・プレイヤーisaacに向かって１つの弾（弾幕を避けてる間にこのさりげない一発を食らう可能性があり注意。）
２
・フェーズ１と同じ
・分裂する４つの弾を出す。
・Angelic Babyを召喚する。
・Conquestのと同じ天の光をランダムで出す。
３
・飛んで移動する。
・テレポートをし１２方向の弾幕をする。
・姿を消して部屋中に大量の天の光が降り注ぐ。左右の角が安置。
・ボスisaacを横切ろうとすると前に立ちはだかる。
数少ない笑顔で死ぬボス。
おそらくThe PolaroidルートはIsaacが自ら救う選択なのだろう。
7.Satan
出現ステージ：Sheol
HP：第一形態 600/第二形態 600
関連ボス：The Fallen, Mega Satan
サタンとは「敵対する者」の意味であり、キリスト教では悪魔のボスを指すことが多い。
母親をそそのかしたのはどう考えても神ではなくこのSatanに思われるが果たして・・・？
積極的かつ戦略的な攻撃をするボスで油断できない。
アイテムの聖書を使うとisaacが死ぬので厳禁。
３段階の戦闘をする。
１
「Face Hell！」の叫びの直後にThe Fallenと２体のKamikaze Leechとのバトルになる。攻略ウィキ見るまで「isaac」だと思ってました。
２
サタンの像が動き出し攻撃を開始する。積極的かつ戦略的である。
・頻繁に手から左右に弾を出す。
・口から５、６に分かれた弾をisaacに出す。
・アイザックの位置に合わせてブリムストーンを出す。
左右にいるとき：両手からisaacを追尾するブリムストーンを出す。
正面にいるとき：口から前にブリムストーンを出す。
いずれも攻撃モーションを注意すること。
３
サタンが倒れ空を飛ぶ。以下の２パターンの攻撃をする。
・The Momのと酷似した巨大足踏みつけ攻撃を２連続高速で行う。この足しかダメージ判定はない。
・Kamikaze Leechを召喚する。
踏みつけ攻撃はひたすら歩き回ってると避けられるがKamikaze Leechが厄介。Kamikaze Leechを優先的に対応しSatanの足を爆発の巻き添えにさせるのは合理的な良い戦い方である。
6.The Lamb
出現ステージ：Dark Room
HP：頭 2000 / 体 600
わたしはまた、御座と四つの生き物との間、長老たちの間に、ほふられたとみえる小羊が立っているのを見た。
−ヨハネの黙示録5:6 (口語訳)
「御座にいますかたと小羊とに、さんびと、ほまれと、栄光と、権力とが、世々限りなくあるように」
-ヨハネの黙示録5:13 (口語訳)
小羊が第六の封印を解いた時、わたしが見ていると、大地震が起って、太陽は毛織の荒布のように黒くなり、月は全面、血のようになり、天の星は、いちじくのまだ青い実が大風に揺られて振り落されるように、地に落ちた。
-ヨハネの黙示録6:12-13 (口語訳)
Lambとはラム肉でおなじみ子羊の意味である。聖書では子羊はイエスをしめすことが多いが、黙示録の子羊は、世界の終末の封印を解く恐ろしい権威者として描かれている。第二〜第四の封印でHarbingersを解き放ったのは彼である。
Dark Roomにおけるラスボス。Dark Roomがそもそも新しいアイテムを入手しにくいので???戦のように準備ができるとは限らないのに???よりはるかに激しい攻撃を放つ難ボス。
各キャラクターのコンプリートの条件なのは言うまでもないが、キャラクターThe Forgotten, The Lost、アイテムAce of Diamonds、Ace Clubs、ピルのGulps!(=アイテムのMarbles)、特別モードRERUNなどの、数多くのアンロックに関わるボスである。戦闘時も眠りから覚める始まりだしもしかしてIsaac自身なのだろうか、と筆者は考察している。
The Lambには２段階の攻撃がある。
１
・２〜４方向弾
・周囲に爆発拡散弾。溜めてる動作をしたら距離をとるように。
・渦巻き状に回転して打つ弾。
・分裂する弾を半円状に打つ。
・４方向のブリムストーンを出す。回転する可能性がある。
・５方向弾を出し蝿を召喚する。
・２、３方向に紫ホーミング弾を連続して出す。
２
体力が少なくなると頭と体が分離し、それぞれ違う攻撃をする。
頭
・第一段階の全てを行う。
・ある程度距離があると高速で突進する。
・モンストロ式拡散弾かつホーミングする。
体
・拡散弾を吹き上げる。
・蝿を召喚する。
・死ぬと部屋が長時間暗くなる。
5.Mega Satan
出現ステージ：The Chest & Dark Room
HP：第一 3000/第二 2000 / 手 600
関連ボス：Satan, Harbingers, Angels
ダウンロードコンテンツ無しならば間違いなく最強の隠しボス。たどり着くには遭遇確率の低い天使２体を倒さなければならないのでなかなか会うのが難しい。攻撃は専ら弾幕とボス召喚なのでボスを瞬殺する攻撃力さえあれば楽勝だがそうでない場合は雑な弾幕をなんとか避けなければならない難ボス。
Mega Satanは中央の★マークに触れると戦闘を開始する。２段階の攻撃を行う。
１
・極めて鋭角の３、４方向弾を連続して出す。
・４つに分裂する茶色い弾を出す。
・超巨大ブリムストーンを出す。頭の挙動に要注意。
・頭を何度もぶつけて血の拡散弾を出す。
・拳を床にぶつけて円形状の衝撃波を出す。
・両拳を何度もぶつけて衝撃波を最下部まで届ける。
・ダメージを十分に与えずに放置すると中ボスの七つの大罪、あるいはThe Hollowを召喚することがある。
・ダメージを十分に与えるとMega Satanは身を潜めHarbingersを召喚。FamineとPestlience、WarとDeathの組み合わせで現れる。Satanにさえ忘れられたConquest
・さらにダメージを十分に与えるとMega Satanは身を潜めスーパー七つの大罪を召喚。Super Envy、Super LustとSuper Wrath、Super GluttonyとSuper SlothとSuper GreedとSuper Prideの組み合わせで現れる。最後は特に厄介な弾幕を形成するSuper GluttonyとSuper Prideを先に倒しておきたい。
・さらにダメージを十分に与えると黒くなったUriel、黒くなったGabrielが召喚される。若干HPが高い。
２
十分なダメージを与えるとMega Satanは沈み、そして骨の第二形態を表す。
この形態はゆるやかな弾幕が多く、避けることはそれほど難しくない。遠距離であれば遠く離れてひたすら打てばいいだろう。
近距離の場合でも必ず近づける隙がある。
カーブを描いて追い詰めることが多いのでなるべく真ん中にいた方が良い。
倒すことでIsaacが闇落ちするエンディングが見られる。また、Apollyonをアンロックする。
4.Ultra Greed (Afterbirth)
出現ステージ：Ultra Greed
HP：3500
関連ボス：Ultra Greedier
Greedモードのラスボス。
ここでは解説してないがIsaacには中ボスとして「七つの大罪」をモチーフにしたモンスターがいる。暴食（Gluttony）、色欲（Lust）、強欲（Greed）、憤怒（Wrath）、怠惰（Sloth）、傲慢（Pride）、嫉妬（Envy）である。この七つの大罪は、文字通り「七つの大罪」や鋼の錬金術師、サスペンス映画「ヘヴン」などでも有名だが、実は聖書には言及されておらず修道士が書いた著作をグレゴリウス一世が編集して制定した概念にすぎない。
このGreedの究極形態がUltra Greedといえるが、これが相当のプリケツ難ボスである。何が難しいって、このUltra Greed(ier)とHushはダメージ耐性という特殊な能力を持っているからだ。プリケツについては戦うとわかる。
ダメージ耐性の詳細はウィキ（英語）に書かれているが、isaacの攻撃が威力高い/でかい/遅いほど与えるダメージが低いということである。Epic Fetusだと逆に弱体化するのである。その代わり変身Guppyのように連続してダメージを与え続けると体力がどんどん低下する。つまり全体的にステータスが高いことが望ましい。
ダメージ耐性が高いにも関わらずHPもべらぼうに高いUltra Greedだが、攻撃パターンは比較的単純で読みやすい。根気よく倒していこう。
・isaacを発見すると突進する。
・isaacが近くにいると巨大なコインのモンストロ式拡散弾あるいは３方向弾を出す。
・スピンしながらコイン弾を撒き散らす。
・地面を地団駄しながらKeeperなどを召喚する。
・自分の目でスロットする。目のシンボルによって落ちてくるコインの効果が変わる。絵が描かれたコインはisaacにダメージを与えないので、接触するとウンチになるE Coliがかなり有効。
→両目ともハートの場合 - HP40のハートコインが落ち、しばらくするとUltra Greedを回復させ、加速させる。何が何でも破壊しよう。
→両目とも爆弾の場合 - HP50の爆弾コインが落ち、しばらくするとメガ爆弾の範囲で爆発する。攻撃して撃破しても爆発しないのでそばに安置がない場合は破壊していこう。
→両目とも鍵の場合 - HP60の鍵コインが落ち、しばらくすると扉の鍵を開き、HP9の雑魚敵Greed Gapersが大量に襲撃してくる
→両目が一致しない場合 - HP50のただの巨大コインが落ち回転する。このコインはisaacにダメージを与える。
・敵が多いと受け身を取ってダメージをほとんど受け付けなくなる。
2.Hush (Afterbirth)
出現ステージ：??? (Blue Womb)
HP：6666
関連ボス：???
Hushは「静けさ」を意味する。Mom's Heart及びにIt Livesを３０分内に撃破すると対戦できる隠しボスである。
作者Twitter曰くアイザックの差し迫った死を表すボスらしい。
徹底的に弾幕ボスであり、尋常じゃないHPをもつ上にダメージ耐性を持つ。このため長期戦になりやすく挑む際には心の準備が必要だ。
Hushは二つの形態を持つが第一形態はHPが半分の???である。この???を難なく倒せないとHushは倒せないといっても過言ではない。もはや???はかませ扱いされる可哀想なラスボスである。
第二形態からが本番である。５段階あり、HPが全体の20%減るごとに一旦沈んで無敵状態になり、攻撃が新たに追加されていく。
HP 100%時はあらゆるパターンの弾幕。
HP 80%時は中央に寄って、蝿召喚を追加。この蝿は大量の割にHPが10と妙に高いので注意。
HP 60%時は叫んでBlue Gapersを大量に召喚し、地面に沈んで動きながらBlue Gutsを召喚という技が追加される。Blue Gutsは１〜３方向弾を出すが、回復力が異様に早いので注意。
また、Continuumに似た、ステージの左端から右端、上端から下端にワープする弾を３列大量に出す攻撃も追加。加速するので、最初は緩やかでもすぐに弾丸の嵐が吹き荒れるが、軌道が同じなので必ず安置が存在する。この攻撃は２〜５回連続して行われる。
HP 40%時は地面に沈みながら普通に弾を打つことができるようになる。この時Blue Gutsも召喚する。
また叫んで大量に分裂する３つの弾を出す攻撃も追加。
HP 20%時は涙のレーザービームを天井に打ち、降り立った地点がアイザックを追いかける攻撃が追加される。このレーザーの速さはアイザックのスピードと全く同じように設定され、Stop watchなどでHushの動きが遅くなっても変わらないので注意。
さてHush対策なのだが以下の状況はこちらに好都合である。
・Pretty FlyやCube of Meatなどのダメージ防御を３つ持っている。→弾がかなり当たらなくなる。
・The Soulを所持している。→急激に動かなければ必ず当たらない。
・Stop WatchやピルI'm Drowsyなどで遅延効果がついている。→ヌルゲーになる。天井レーザーのみ注意。
・Selphant KissあるいはMaw of the Voidを持っている→雑魚敵から回復ハートを大量に得るチャンスがある。
・Guppyに変身している。Moms Knifeを持っている→ダメージ耐性のシステム上Hushは連続ダメージに非常に弱いので手早くHPを減らせる。
・攻撃してくれるオプションとGnawed Leefを持っている→死ぬほど時間がかかるが待ってるだけで勝てる。
2.Delirium (Afterbirth+)
出現ステージ：The Void
HP：10000
関連ボス：全ボス
Deliriumはせん妄の意味である。Isaac自身の狂気を表してるとも言えるし、あるいは死に近づきつつあるisaacの錯乱とも言える。
最大のHPを誇るボスである。攻撃パターンは極めてシンプルで、弾幕をはりながら今まで出会ったボスにランダムに擬態をする。これだけである。ボスはIt livesはもちろんThe LambやMega Satanなどの最終ボスにも擬態する。
つまり黒幕は悪魔ではなくisaac自身の狂気だったということなのか。
ボスは強化形態になってる時もある。
こういった特性からパターンを読むことが不可能なボスであり臨機応変に戦わなねばならない難ボスである。
弾幕は白い弾は通常弾で、緑の弾は爆発する。
擬態ボスのダメージはDelirium全体のダメージとして共有される。
またDeliriumのHPの割合は擬態ボスの攻撃パターンに変化を与える。例えばWarは50%で馬を破壊するが、Deliriumの残りHPが50%のときに彼に変身すると馬に乗っていない。
にも関わらず擬態ボスの「最大HP」はそのボスと同じように設定されている。しかし最大HP以上攻撃しても死なない。この最大HPが何を意味するのかというと、最大HPの１０%を奪うSharp Strawの効果が擬態時にかなり薄くなるということだ。狙うなら球体である本体の時にしよう。
HPが残り少ないほどボスの擬態の交替がより高速になり、しかも移動も早くなる。これが極めて危険であり、例えばMonstroが瞬間移動で踏みつけてくることも起きる。
ボスを一発で殺す武器にChaos CardとPlan Cがあるがこれに対応できる唯一のボスがDeliriumである。
Deliriumはどんなボスでも即座に殺すはずのChaos Cardが効かない。
Plan Cも死亡時に長い演出があるのでDeliriumが死ぬ前にIsaacが死んでしまう。（即座に復活するLazulusだけが使える。）
まさにIsaacの真のラスボスにふさわしいランダムの強さを持つ・・・がこれでも筆者は二位とした。
1.Ultra Greedier (Afterbirth+)
出現ステージ：Ultra Greed
HP：(Ultra Greed: 3500) / 2500
関連ボス：Ultra Greed
栄えある一位はUltra Greedの強化版、Ultra Greedierである。Greedierモードのラスボスで、Ultra Greedを倒して像になった後に自ら突き破って現れる。
なぜ強いのかというと、AIが優れてる上に、攻撃の全てが大爆発だからだ。
大ダメージの攻撃かつこちらからのダメージチャンスが少なく、その上Ultra Greedからの連戦による高いHPとダメージ耐性があるという鬼のような性能を持ったボスである。
ただし攻撃の特性上Host hatやPyromaniacを持ってるとヌルゲーにはなる。
以下の攻撃パターンを持つ。
・地面を叩くと扉が開き、扉からブリムストーンレーザーが出る。
・接近すると３方向あるいはモンストロ式拡散をする爆発コインを飛ばしてくる。
・遠く離れるとUltra Greedierが高飛びし爆弾を落としながら接近して落ちて衝撃波を放つ。
・地団駄を踏んで爆弾コインを落とす。この爆弾コインはコインを落とす。
安置などない。中距離を保って爆発に注意しながら攻撃するしかない。
しかしこんなボスでもKeeperだと回復源が無限に手に入るので捨て身の攻撃でいけたりする。金が絡む時だけKeeperは強い