企業の構築すべき組織構造は、企業文化（組織文化）やビジネスモデルによるところが大きいと私は考えています。
・大量生産をするメーカーのような企業
どうしても指揮命令系統がはっきりとしていて、集団としての従業員の働きをマネジメントしやすいピラミッド型が採用されることが多いと思います。
・サービス提供、サービス企画提案型の企業
個人の裁量がより大きく、意思決定がスムーズに行われ個人の小回りが効くようなフラット型組織が有効に思います。
また、ひとつの企業内の役割においても使い分けを検討してもよいと感じます。
生産部門はピラミッド型組織、企画部門や営業部門はフラット型組織といった具合です。