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（創造主官ノスタルジア）
※ノスタルジアもややこしいので説明しますと、まず消滅都市にはノスタルジアという組織が存在します。
しかし小説ではその名前だけを取り、大幅に設定を変えています。
それが創造主官と創造主神官になりますね。
創造主神官の7人は全員オリキャラなので書きませんが、創造主官の方にはちらほら消滅都市キャラが居るのでそのキャラのみ書いておきますね。
クズキ
※元政治家。
ソル
※ノスタルジアの兵隊。タイヨウの遺伝子により作られた人造人間。
カヤ
※元軍人。
フジエ
※元ジャーナリスト。
セリカ
※元は何もない普通の一般人の女の子だったが、ノスタルジアの実験の被験者として拉致された人物。
キキョウ
※チーフ、スズナの元上司に当たる。
ビッグバン・ゴッド云々の設定はオリジナル。
ドクター
※本名は不明。
名無しの刺客
※本名は不明。
※また、ノゾムやスズナといったノスタルジアに所属している者でも別勢力に身を置いている者は省きますね。
（ピグマリオン）
※ノスタルジアの特殊部隊で、人形使いで構成されている組織です。
因みに、一部メンバーはオリキャラなので、オリキャラは除外します。
リディア&ソフィア
※リトルミルがタクに渡した人形ですね。
後にピグマリオンのメンバーが作った人形である事が明かされます。
そして、リトルミルも実はピグマリオンのメンバーであったりもします…。
因みに、リトルミルもピグマリオンにした理由は、リディア&ソフィアやリトルミルのミガワリちゃんが元々作られたのがピグマリオンだということが本家では語られていたからですね。
ガーネット
ビャクグン
※ピグマリオンの人形使い。
サマーズ・サン、オリベ、ウスズミと深い関わりが有る。
サマーズ・サン
オリベ
※サマーズ・サンがタロットを使う設定はオリジナルです。
また、この二人は姉弟で姉がサマーズ・サン、オリベが弟ですね。
ウスズミ
※御館様と呼ばれている、ピグマリオンのリーダーに当たる人物。
（オカルト研究部）
※殆んど小説内では触れられてない組織です。
スクールの部活ですね。
ミツオ
※終末思想を語るオカ研のまとめ役。
ノスタルジア云々の設定はオリジナルですね。
ミツオもこちらに所属しているので、ノスタルジアの方には書きません。
ホノカ
※パイロキネシスト。
ゴウタ
※ダウジングトンファー。
セイナ
※まぼろし怪奇ファイル。
ランコ
※恋禁術師。
アイラ
※オカルト研究部部長。
（ブラックオーダー）
※失われし世界の謎の組織と小説内では言われましたが、実際の消滅都市ではまた違う組織という事になっています。
ブラックオーダーには、平行世界の存在が所属していて、こちらはアキラとジョニーウォーカーのように別人と捉えて貰いたいので、書いておきます。
（最上級幹部）
ヨシアキ
リサーチャー(本名はユミコ)
マミ
マリー
コトネ
ジン
ナツメ
シズマ
（上級幹部）
マイケル(本名はマイケル・ブライアント)
ユイ
チアキ
スズメバチ(本名はヒロト)
シオリ
トウヤ
（メンバー）
ギーク
コトハ
ミサ
ナツキ(BOではカエル戦士と呼ばれる)
クミ
ユウタ
ケイゴ
クロウ
マリナ
モエ
D
マイ
ジャック(本名はカンキチ)
ユキ・複製品(レプリカント)
※赤い髪のユキですね。
ブラックオーダーに捕らわれていたというのはオリジナル設定何ですが、ユキをベースに作られたクローンだというのは実際の消滅都市でも言われています。
球根の中に吸収させる…みたいな事を言ってたのは後の展開で分かると思いますが、クローンではないオリジナルのユキになります。
（無時空(タイムレス)）
この無時空という組織は小説で考えた組織なので消滅都市には存在しません。
ソウマ(青年)
※青年の姿をしたソウマ。少年のソウマとは別個体に当たる。
トップシークレット云々の設定とノスタルジアである事がオリジナルですね。
あとは実際の消滅都市だと、特にべオと接点がある訳でも無いようですが、小説ではべオともっと近しい関係にしております。
シズク
※無時空の兵隊ですね。
同じ兵隊であるカルマというのも居ましたが、カルマは小説で勝手に考えたオリキャラです。
元ネタは、消滅都市の中で使える金みたいな物にシズクはキャラとして出てるのにカルマは無いからカルマも出しちゃおうって事からそうなりました‼
仮にカルマが実際に登場したら、オリキャラではなく消滅都市キャラとして使おうと思っています。
因みに、もう一人、アニマというキャラもオリキャラですね。
イデア
※まだ出てきてないので詳しくは言えませんが、ゼータが言っていたアルコとウチュウの融合した姿…っていうのがオリジナル設定になります。
実際の消滅都市だと、消滅都市のゲームにおける失われし世界のストーリーのラスボスです。
また、イデアの元ネタはイデア論から来ていると思われます。
イデア そして全ては廻り巡ってゆく
※イデアが進化した姿。
実際の消滅都市だと、赤い髪のユキが変化したもの。
（その他）
※別に勢力として所属はしていないキャラ達はここに纏めておきます
ツトム
※カナの兄。
アイリ
※子役女優の女の子。
ビッグバン・ゴッドのアイリとは別人。
マーキュリーデビューという肩書きがありますが、実際はハリウッドデビューですね。
これはマサヒトをハリウッドスターからマーキュリースターにしたので、アイリもそうしたという感じです。
マイケル・ブライアント
※寿司ゴルフ。マイケル田中という偽名を使って生活している。
ゲームマスター
※デスゲームの主催者。
トップシークレットの設定、観測者等の設定はオリジナル。
正体はサトルだが、サトルとして出てくる存在とは別個体。
後にタロットカード"審判"保持者となるが、実際はタロットカードの真のマスターでもある。
サトル
※科学者。
無時空云々やトップシークレット、ノスタルジアである事の設定はオリジナル。
ハヅキ
※サトルの元恋人の兵器化。
ハヅキのクローン、量産型ハヅキというのも出しています。
後にタロットカード"吊るされた男"保持者となる。
マミ
※発明家。
クロウ
※闇医者。
ユウリ
※医者。
ユイ
※スナイパー。
女子高生のユイとは別人。
ハルアキ
※陰陽師。
ムドウのライバルだとかの設定はオリジナルです。
ムドウ
※百魂夜行の主。
エクセリオンと友好関係にあった等の設定はオリジナルです。
アキナ
※宝石商人。
ミカ
※カメラマン。
ミオ
※彫刻家。
チエ
※デザイナー。
D
※殺人鬼。元裏稼業組織。
ハルナ
※化学者。
ユミ
※迷子の少女。
ミサ
※ユミの姉。
テルアキ
※記者。
小説のシュタゲコラボ編で、桐生萌郁がバイトしている編集プロダクション アーク・リライトで働いているという設定があったが、あれはコラボ編限定のオリジナル設定。
シュンサク
※船長。
ナオ
※宇宙飛行士。
イッセイ
※天文学者。
アキヒコ
※小説家。
サリナ
※生徒会長。
マユリ
※スクールの生徒。
ケイコ
※スクールの生徒。コンビニバイト。
ママのケイコとは別人。
ユウタ
チホ
カズコ
キドウマル
※神父ユウタ、巫女チホ、占い師カズコ、天狗キドウマル。
ムドウ関係者だという設定はオリジナルです。
ミライ
※マーキュリーロストの国宝の設定はオリジナルで、実際は人間国宝ですね。
ルナ
※弓道少女。
カケル
※鳥人間。
ケイ
※バーチャルシンガー。
バンドグループ アミッシュでも使われる時があるらしいですが、マミの発明品なのでこちらに書いておきました。
ザ・デストロイ
※レスラー。
謎の組織に利用されていましたが、完全に組織の一員という訳では無いのでこちらに書いておきました。
ミヤ
※メイド。
ミオリ
※鳥と会話出来る少女。
エマ
※シスター。
ナナセ
※スケート選手。
ミナコ
※気象予報士。
リュウヤ
※保健の先生。
ココナ
※ウェイトレス。
サエ
※CA。
イズミ
※看護師。
ユキエ
※モデル。
カイト
※美容師。
巫女の兄のカイトとは別人。
エイタ
※バリスタ。
キョウヘイ
※漁師。
ジュリ
※呪術師。正確に言えば、ゲームのキャラクター。
ジョウマ
※漫画家。
ケンゴ
※設計者。アキラの友人でもある。
リン
※大工。
アスタリスクのリンや、女子高生リンとは別人。
ナミコ
※アーチャー。
テッペイ
※お花屋。
ヒロミ
※写真家。
ナナホ
※アルピニスト。
ユイナ
※眼鏡屋。
シゲル
※発掘家。
マヤ
エリ
※バレリーナ。
マコ
イコ
※アンドロイド。マコはまことは別人。
ユウキ
※冒険家。
シンノスケ
※スケボー少年。
ミワコ
※釣りガール。
アラン
※俳優。マサヒトとはライバル。
ユカ
※調香師。
メイリャン
※中華娘。
マサエ
※給食のおばちゃん。
イチカ
※時計技師。
シスミ
※投資家。
ジョウ
※映画監督。
ユメカ
※キッズアイドル。
ジュリアンナ
※バブルガール。
タカオ
※モンスターティーチャーと呼ばれている生活指導の先生。
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④に続きます。
※追記、修正有り。
追記①：イデア そして全ては廻り巡ってゆくを追加しました。
追記②：細かい修正。
ドクター、名無しの刺客を追加しました。