寺内（でんでん）の死因は医療ミスではなく、事故に見せかけて絞殺による殺人と判明、警察の捜査が始まった。
白鳥（仲村トオル）と田口（伊藤淳史）は、速水（西島秀俊）が佐々木（堀部圭亮）と寺内を殺害した可能性があると示唆。白鳥たちは、療養施設予定地が、産業廃棄物で汚染された危険な土地だと知っていた二人の口封じをしたのではないかという。
速水が病院からいなくなった。
救急として搬送されてきた速水と佐々木に騒然となる救命チーム。
速水は意識を取り戻したが、佐々木はナイフで胸を刺され、すでに死亡していた。
２人に何があったのかを聞き出そうと速水を問い詰める白鳥。
速水は、佐々木が寺内に大量の鎮痛剤を投与したと告白したことを明かしたが、それ以外のことは何も記憶にないという。
その夜、速水は佐々木からナイフを奪ったことを思い出し、殺したのは自分かもしれないとつぶやく。田口らは衝撃を受けるが、その直後、速水はけいれんを起こして再び意識を失う。
そんな折、ケガを負った女性が救命救急センターに搬送されてきた。鴨志田（本田博太郎）や佐々木が通っていたクラブのママ・斉藤彩子（麻生祐未）だった。
彩子は病院名を聞いて、この病院は娘を見殺しにしたから嫌だと取り乱す。
彩子は、過去に城東デパート火災で、この病院で子供を治療してもらえず亡くしていた。子供は「ブラックタグ」で治療が出来ないと判断された。隣にいた医師の知り合いの娘は同じ「ブラックタグ」だが、治療してもらえた。その「ブラックタグ」の娘は、和泉遥（加藤あい）で速水の治療で命を救われ医師を目指した。
和泉は彩子に謝るが、彩子は助かったか気になっていたという。
彩子は、速水が入院していることに気づいた。
速水は覚えていて、子供を助けられなかったことを謝り、助けられなかった患者のことは、決して忘れないという。
彩子の転院が決まり、和泉に前より少しこの病院が嫌いでは無くなったと話した。
佐藤（木下隆行）や和泉（加藤あい）、長谷川（戸次重幸）ら救命チームは、単なる過労とは思えない速水の病状に気を揉んでいた。そんな一同に白鳥は、速水が佐々木、さらに寺内まで殺害した可能性があると告げる。
療養施設の建設にこだわっていた速水が、その計画を妨げる土壌汚染の事実を知る２人の口を封じたのではないかというのだ。
一同に動揺が走る中、花房（白石美帆）が現れ、寺内殺しの犯人は速水ではないと断言。寺内が殺された時間、速水はＭＲＩ室で自分を撮影していたとアリバイを証言する。
翌日、凶器のナイフから佐々木と速水の指紋が検出され、警察は収賄関係にあった２人の仲間割れと見て捜査を開始。
しかし、真相はほかにあるとにらむ白鳥と田口は、独自の調査に乗り出す。
速水は心筋の炎症によって心機能が急激に低下し、心不全に陥っていた。悪性リンパ腫が心臓までむしばみ始めているとみた佐藤らは、手の施しようがないとがく然となる。
速水は佐藤に延命治療の必要は無いといった。
一方、佐々木が殺された事件の真相を追う白鳥と田口は、自分が犯人だと主張する速水が誰かをかばっているとにらむ。
花房に疑惑を向けた白鳥は、田口とともに事件現場を調べ、意外な事実を知る。
翌日、白鳥と田口は花房を連れて再び現場へ。白鳥の追及に激しい動揺をみせた花房は、事件の夜、現場にいたことをついに認める。だが、佐々木を殺したのは自分ではないと訴え、現場を訪ねた理由を打ち明ける。
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フリージャーナリストの目黒（嶋田久作）は、速水と佐々木の関係を探り、回復していたが死亡。
鴨志田と繋がりのある寺内（でんでん）は末期ガンで入院し、白鳥たちに何かを打ち明けようとして、その前に殺された。
速水は「メディカル・アソート」社員佐々木との癒着を自白。速水はその金で治療に必要な高い薬を買っていた。新病院を設立、速水は医院長になる予定だった。
鴨志田一郎は、佐々木と繋がり、「メディカル・アソート」主導の病院開発を推進していた。
病院建設予定地は、産業廃棄物が地下に埋められ、汚染された土壌で危険な土地に病院建設など出来ない。
速水も佐々木もそのことを知らなかった。
佐々木は速水を呼び出し、自殺をしようと思ったが自分では出来ないので、ナイフを渡して殺して欲しいと頼む。
速水はナイフを受け取って投げ捨て、寺内を殺したのは別人と分かるが、苦しくなり倒れてしまう。気づくと佐々木は倒れ、人の声が聞こえた。その声は花房だと速水は思い出す。
花房が犯人と速水は思って、自分が殺したと言って庇ったのか。
しかし、花房が佐々木を刺す理由が分からないし、倒れている速水を見捨てたのは、偶然遊びに来たスケボー少年たちに気づいて逃げて、少年たちが救急車を呼んだのかな。
花房はミスリードで、別に犯人はいるはずだ。
ラス１前に真犯人を出すワケがない。
では、佐々木を殺害して得する人物は誰か？
チーム・バチスタは、隠された真実が多いから、予想が難しい。
原作や映画とも違うので、犯人も変えているかもしれない。
チーム・バチスタ２は１話完結なので、見やすいけど最後に近づいて、白鳥さんの追っていた医師と製薬会社の癒着から、殺人事件へサスペンスっぽくなって、白鳥＆グッチーコンビの探偵物みたいになってきた。
バチスタキング・ジェネラルルージュのオレ様男・速水は、曲げられない男なので、経費削減で薬代を惜しむ治療をしたくないので、高い薬を献金で買って、医師たちの手が足りないのに無理して患者を受け入れるが、天才的な医術で同様に働いているから、反発はあるが速水を尊敬し、従っていた。
東条医大に見切りをつけていたと思われた速水は余命が短いと思い、新病院を残して、チーム・バチスタの受け入れを増やし、救急病院を増やせば患者を一人でも多く救え、きつい労働条件の医師たちのためにもなる。
たとえ、手を汚しても金は金、人を救うためなら汚名もバッシングも持さないオレ様速水は、人気急上昇だ。ただのふんぞり返った、偉そうに口やかましい、チュッパチャプス好きでは無かったようです。
喘息まであったんだね。
その速水の夢は、汚染土壌発覚で頓挫されて中止。ショックでガッカリして、闇に落ちたのは佐々木も同じで、寺内を殺したのが無駄になり、唯一理解してもらえそうな速水に頼んだのか。
佐々木にしてみれば、会社のためだけでなく、自分の夢となった新病院を設立するため、どんなこともしてきたのに、かわいそうでした。仕事第一のサラリーマンの悲哀。目標達成のために道を踏み外す。
チーム・バチスタはいつもメンバーが揃っていて、休んだ人を見たことが無い。交代制の休日とか無いのか。
経営難の病院、医療ミス疑惑、病院内に殺人者がいれば評判はがた落ちで、彩子のような患者は増えるだろう。救急受け入れ中止、倒産もありうる。
彩子のヒステリックな狂気を思わすモンスタークレーマーは、大げさな演技で引いたけど、俺の言うことを聞いていれば大丈夫と上から目線で無理強いする医師には、あれぐらいオーバー演技をしないと言うことを聞いてくれないのかもしれない。メモメモ。
麻生祐未さんは、「ヤマトナデシコ七変化」でも、山Pの痛い母親の役で怪演していたな。それを見て起用されたのかもしれない。
和泉と彩子の偶然過ぎる出会いで、うそーんって感じだけど、速水の株上げエピソードで、ブラックタグでも、速水のゴッドハンドなら、生還させられるってことだね。ブラックタグを付けた奴の立場がないな。それだけ、人数が多いとパニクルということだね。やはり、医者は信用できない。
経営破たんの病院、疲れ果てた医師たち、少ない看護士で、入院受け入れ拒否、患者のたらい回し、助かる命が助からない。医学界の現状と同じだ。（竹野内豊さんの「Tomorrow 陽はまたのぼる」でも同じことを書いた気がする）
いい病院でないと、いい医師は増えず、スタッフはいなくなり、機材も新しく出来ないからお客も減る。
病院だけでなく、テレビ界も同じだ。不況の影響か？
視聴率は１５．６％。前回気になる終わり方だったので、上がりましたね。やっぱ、釣りは大切だ。
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