前回に引き続き、2019年度の9号目のネイチャーのハイライトより。
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発生生物学：発生中のマウスについての単一細胞アトラス
Nature 566, 7745
2019年2月28日
発生生物学：発生中のマウスについての単一細胞アトラス
Nature 566, 7745
2019年2月28日
動物の発生において、組織は原腸形成の際に生じる。胚の未分化細胞が、成体個体を構築する器官特異的な細胞タイプを作り出す仕組みを理解することは、発生生物学における重要な目標である。B Göttgensたちは今回、マウス胚の、原腸形成から初期の器官形成の段階に由来する10万個以上の単一細胞について転写プロファイルを解析した。彼らは、多能性状態から胚細胞系譜までの分化経路について調べ、内胚葉の細胞系譜の収斂が起こることを明らかにしている。著者たちはまた、この参照地図を用いて、中胚葉の指定に関与するTal1遺伝子の機能が失われた結果生じる、細胞タイプ組成の撹乱について解析している。
Article p.490
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本論文においては、日本語版本誌では、「発生生物学：マウスの原腸形成と初期の器官形成についての単一細胞分子地図」と題されています。
フルテキストを直訳しますと・・・
マウス原腸形成と初期器官形成の単一細胞分子マップ
となり、Abstractを直訳しますと・・・
動物界全体で、原腸形成は、胚性多能性細胞が成体生物を生成する系統特異的な前駆体に多様化する重要な発生イベントを表します。ここでは、受精後6.5日から8.5日にわたる9つの連続した時点で収集されたマウス胚から116,312個の単一細胞の転写プロファイルを報告します。多分化能からすべての主要な胚系統への細胞分化の分子マップを構築し、内臓および原始線条由来内胚葉の収束に関与する複雑なイベントを探索します。さらに、Tal1^-/-キメラ胚が初期中胚葉の多様化に欠陥を示すことを示すために単一細胞プロファイリングを使用します。したがって、時間情報と転写情報を組み合わせて遺伝子機能を照らす方法を示します。一緒に、このin vivoでの哺乳類細胞分化軌道の包括的な描写は、開発中の遺伝子変異の影響を理解するためのベースラインと、再生医療のためのin vitro分化プロトコルの最適化のためのロードマップを表しています。
となります。
フルテキストは下記です。詳細が必要な方はご購入をお願いいたします。
Full Text：Article p.490
Data availabilityによりますと・・・
生のシーケンスデータは、次のアクセッションでArrayExpressで利用できます。 Smart-seq2内皮細胞：E-MTAB-6970; Tal1^-/-キメラ：E-MTAB-7325;野生型キメラ：E-MTAB-7324。処理されたデータは、https：//github.com/MarioniLab/EmbryoTimecourse2018の指示に従ってダウンロードできます。遺伝子発現オムニバス（GEO）アクセッションGSE87038を使用して、骨髄細胞の注釈をサポートしました（方法を参照）。すべてのコードは、リクエストに応じて、https：//github.com/MarioniLab/EmbryoTimecourse2018で入手できます。アトラスはhttps://marionilab.cruk.cam.ac.uk/MouseGastrulation2018/で閲覧できます。他のすべてのデータは、合理的な要求に応じて、対応する著者から入手できます。
Change historyによりますと・・・
2019年4月26日この記事では、補足表とソースデータファイルは元々間違った順序でアップロードされました。
究極に溜まりに溜まったネイチャー。次回は、「発生生物学：マウスの発生における細胞アトラス」を取り上げます。
※巡回等・ブログ活動が大変に遅れており、大変申し訳ございません。
