免疫学：ヒトの免疫レパートリーの解析

前回に引き続き、2019年度の8号目のネイチャーのハイライトより。
 

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免疫学：ヒトの免疫レパートリーの解析
Nature 566, 7744
2019年2月21日

J Crowe Jrたちは今回、3人の成人から採取した循環血中のB細胞および単核細胞に対して免疫グロブリン遺伝子やB細胞受容体遺伝子の塩基配列解読を行い、また3人の新生児のデータを追加して、公開されているデータセットと比較することで、ヒト適応免疫レパートリーの全体のサイズや遺伝的多様性について評価した。この解析は、治療抗体、がん免疫療法、ワクチン研究の分野において重要なものになると期待される。

Letter p.398

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本論文は、日本語版本誌においては、「免疫学：ヒトB細胞受容体レパートリーにおいて高頻度で共通したクロノタイプ」と題されています。

フルテキストを直訳しますと・・・

ヒトB細胞受容体レパートリーにおける共有クロノタイプの高頻度
 

となり、Abstractを直訳しますと・・・

ヒトゲノムには約2万個のタンパク質をコードする遺伝子が含まれています[1]が、テンプレート化されていない接合部の追加（B細胞上）を伴う遺伝子セグメントの組換えによって生成される適応免疫系の抗原受容体のコレクションのサイズは不明ですが、それは確かに数桁大きくなります[2]。個人が一意の（またはプライベートの）レパートリーを所有しているか、共有（またはパブリック）レパートリーの実質的なコンポーネントを所有しているかは確立されていません。ここでは、いくつかの個体で組換えおよび発現されたB細胞受容体遺伝子を配列決定して、B細胞受容体レパートリーのサイズと、これらが個体間で共有される程度を決定します。私たちの実験は、各個人の循環レパートリーが900万から1700万のB細胞クロノタイプを含むことを明らかにしました。私たちが研究した3人の個人は多くのクロノタイプを共有しました。2人の被験者間で共有されるB細胞重鎖クロノタイプの1〜6％（3人全員で共有されるクロノタイプの0.3％）と2人の被験者（それぞれ、λまたはκ軽鎖の16または22％が、3つすべてで共有されました）。 B細胞クロノタイプのいくつかは、クロノタイプ系統内に数千のクローン、または体細胞変異体を持っていました。これらの共有系統の一部は一般的な抗原への暴露によって引き起こされる可能性がありますが、臍帯血サンプルおよびすべての成人レパートリーで共有クロノタイプも特定されたため、以前の外来抗原への暴露が共有レパートリーを形成した唯一の力ではありませんでした。 B細胞レパートリーにおける共有クロノタイプの予想外に高い有病率、およびこれらの共有クロノタイプの配列の同定は、健康および疾患におけるB細胞免疫レパートリーの役割のより良い理解を可能にするはずです。

となります。

フルテキストは下記です。詳細が必要な方はご購入をお願いいたします。

Full Text：Letter p.398

High frequency of shared clonotypes in human B cell receptor repertoires

Data availabilityによりますと・・・

HIPおよびCORDデータセットのシーケンスデータは、プロジェクト番号PRJNA511481でNCBI Sequence Read Archiveに保存されています。分析に使用される適応バイオテクノロジーデータセットのFASTAファイルは、https：//github.com/crowelab/PyIRから入手できます。その他の関連データは、合理的な要求に応じて、対応する著者から入手できます。
 

究極に溜まりに溜まったネイチャー。次回は、「がん：脂肪酸代謝の新しい経路」を取り上げます。

※巡回途中ですが、取り急ぎ取り上げます。巡回等・ブログ活動が大変遅れており申し訳ございません。