前回に引き続き、2019年度の8号目のネイチャーのハイライトより。
----------------------------------------------------------
免疫学：ヒトの適応免疫レパートリーの多様性
Nature 566, 7744
2019年2月21日
免疫学：ヒトの適応免疫レパートリーの多様性
Nature 566, 7744
2019年2月21日
D Burtonたちは今回、10人の健康な成人被験者に対して、ヒトのベースラインの抗体レパートリーの高深度塩基配列解読を行い、その解析結果を報告している。この解析から、各個人の抗体レパートリーは、固有であり、生まれつきの遺伝型と病原体曝露歴の組み合わせによって生じるらしいことが分かった。今回推定されたレパートリー全体の潜在的多様性は、これまで考えられていたよりも大きく、10^16～10^18種類の範囲で固有の抗体が存在することが示された。クロノタイプや塩基配列の大部分は、個人間で広く共通していた。この研究は、ヒト免疫系についての基礎的な知見をもたらしたことに加え、ヒトの健康に関する多数の領域に重要な影響を及ぼし、多くの生物医学領域を超えて科学者や臨床医の興味を引く画期的なデータセットを示している。
Letter p.393
----------------------------------------------------------
本論文においては、日本語版本誌においては、「免疫学：ヒトのベースラインの抗体レパートリーには著しい多様性があるにもかかわらず共通性が見られる」と題されています。
テキストを直訳しますと・・・
ベースラインのヒト抗体レパートリーの例外的な多様性にもかかわらず共通性
となり、Abstractを直訳しますと・・・
原則として、ヒトは適切な状況で非自己抗原分子に対する抗体反応を起こすことができます。この柔軟性は、ナイーブ抗体の大きなレパートリーの存在によって達成され、その多様性は、抗原曝露後の体細胞超変異によって拡大します[1]。ヒトにおけるナイーブ抗体レパートリーの多様性は、少なくとも10^12個のユニークな抗体であると推定されています[2]。健康な成人の末梢血B細胞の数は5×10^9のオーダーであるため、循環B細胞集団はこの多様性のごく一部しかサンプリングしません。ヒト抗体レパートリーのフルスケール分析は、主にサイズが大きいため、非常に困難です。 1人の再配列された抗体およびT細胞受容体遺伝子のすべてによってコードされる情報量-適応免疫系の「ゲノム」は、ヒトゲノムのサイズを4桁以上超えています。さらに、Bリンパ球集団の多くは、生きている被験者から包括的にサンプリングできない器官または組織に局在しているため、ヒトのレパートリー研究は循環B細胞に焦点を合わせています3。ここでは、10人の被験者の循環B細胞集団を調べ、現在までに説明されている適応免疫受容体配列の最大の単一コレクションであり、約30億個の抗体重鎖配列を提示します。このデータセットにより、ベースラインのヒト抗体レパートリーの前例のない深さおよび粒度での遺伝学的研究が可能になり、研究対象の個々のレパートリー、普遍的に共有されている抗体クロノタイプの亜集団、および抗体レパートリーの例外的な全体的な多様性が明らかになります。
となります。
フルテキストは下記です。詳細が必要な方はご購入をお願いいたします。
Full Text：Letter p.393
Data availabilityによりますと・・・
この研究の結果を裏付ける配列データは、NCBI Sequencing Read Archive（www.ncbi.nlm.nih.gov/sra）のBioProject番号PRJNA406949で入手できます。生および処理済みのデータセットは、www.github.com / briney / grp_paperで入手できます。
究極に溜まりに溜まったネイチャー。次回は、「免疫学：ヒトの免疫レパートリーの解析」を取り上げます。
※巡回等ブログ活動が大変遅れており申し訳ございません。体調不調に加え、PCのトラブルで回避に時間がかかりました。
