なんとか描画までステンシルバッファがエミュレータで使えないのは諦めて描画周りの実装はじめ。ついでにちゃんと確認はしてないけどglBlendFuncSeparateOESもどうもエミュレータでは使えないっぽい。GLSurfaceView.RendererクラスのonDrawFrameからjniの描画関数を呼び出して画面描画できることが確認。ステンシル使えないから見た目が変ですよ!次はスレッド周りの実装とクリックイベントの取得かな。