Independence day

今日は独立記念日で学校業務は全て休みだったが、昨日の実験の続きをするために研究室に行った。休日なので少しのんびりと11時前くらいに着いたのだが、なんとほぼ全員来ていて普通に実験をしていた。誰もいないとは思っていなかったが、せいぜいいても3分の1くらいだと思っていたのでかなり意外。このラボの人たちはよく働くようだ。多少のプレッシャーはあるけれど、研究をするという面ではいい環境なのかもしれない。PIも若手で上り調子だし、このラボはこれからどんどん結果を出していきそうな気がする。

実験自体は２，３時間で終わったので、とりあえず家に帰って昼食後、明日のmini group meeting用のhand outを作成。前回は初めてで、全く様子がわからず適当に作ったのだが、今回は他の人たちのも参考にしつつ、簡単にまとめてみた。正直結果という結果は何もないけれど、目標に向かって前進はしているのでいいことにしよう。

この研究を始めて4週間ほどたつが、待ち時間が多い実験というのはときどきfrustratingに感じることもある。以前の研究は、有機化学主体だったのだが、ごくたまに待ち時間の長い反応をやるくらいだったので、常にやることがあり、どんどん実験を進めることができた。まぁ9月になって授業が始まったら勉強でかなり忙しくなるのは間違いないので、研究はある程度余裕があるくらいの方がいいのかもしれない。

明日は朝から今日培養したサンプルの後処理をする予定。70本ほどサンプルを作ったので、明日の午前中はこれだけでつぶれそうだ。。。。。

This is what it should look like!

今日もこれまでとほとんど同じ実験の繰り返し。PCR、ligation、transformation、digestion etc...

何度もやった作業なので独りでも問題なく進められるようになった。

昨日失敗したPCRはtemplateを変えてやり直し。今回ははっきりとsingle bandが観察できた。これまでやったPCRの中で一番うまくいったと思う。非常にキレイなので今度のmini group meeting用hand outに載せたいところだ（笑）　

なんだかんだで時間がかかり電気泳動終えたらもう夕方遅くになってたので、double digestionをしかけサンプルをインキュベーターに入れて一旦帰宅。夕食後、再びラボに戻り、後処理をして今日は終了。ラボに戻ったのは9時頃だったが、2人がまだ実験していた。休みの日に実験をしても夜はあまり遅くまでやらないのかもしれない。

明日はindependence dayなので一応休日だが、今日のminiprepの続きをやりに少しだけラボに行く予定。店もほとんど開いていないだろうし、木曜のmini group meetingの準備でもしようかな。

Gal4

最近、同じ作業を繰り返しているせいか、その日に何をやったのか思い出しづらくなってきた。。。

今日も先週と似たような作業がほとんど。miniprep、ligation、そしてPCR。

新しいことと言えばLife Sciences InstituteにあるDNA Sequence Core Facilityにサンプルを提出しに行ったことくらいか。Life Science Instituteは以前日記に書いたEnzyme Storeがある建物で、新しくてきれいな上に、天井が高くて開放感がある。今いる化学科の建物よりはるかにいい。このDNA Sequence CoreにTemplateとPrimerを提出すると、2日ほどでsequenceの結果が返ってくる。今回提出したのは、先週作成したfusion proteinをコードするinsertを組み込んだプラスミド。水曜日はIndependence Dayで休日なので結果が返ってくるのは木曜になりそうだ。木曜は午後からmini group meetingがあるので、午前中に結果が出れば発表できるかも。もちろん上手く行っていればの話だが。

そういえば今日のPCRでとてもくだらないミスをした。電気泳動でproductsを確認したのだが、全くバンドが見られない。理由がわからずmentorのポスドクに相談するも、彼にも何故だかわからない。しかし、しばらく考えているうちに彼があることに気づいた。これまでPCRを行ったサンプルは全てhumanのもの。当然templateもhuman cDNAを使っていたわけである。しかし、今日のサンプルはGal4→ヒトにはないタンパク。ヒトのcDNAを使ったら何もできなくて当たり前である。

ポスドクと実験内容の打ち合わせをしている時にそういうコメントがなかったので、知らなくても仕方ないと言えば仕方ないのだが、勉強不足の感は否めない。。。。。

正直、あまり慣れていない分野なので実験で手一杯な部分もあるのだが、もう少し細かいところにも注意を払って実験を進めるように心がけよう。