ルーサー邸に何者かが侵入し、レックスとラナはシェルターに向かう。しかし途中でレックスが、忽然と姿を消してしまう！クラークはその連絡を受けるが、ゾーナーの仕業と思われる残虐な事件の調査を優先する。
突然消えたレックスを探すためにクロエに助けを求めるラナ。
しかし真相を突き止めようとしたとき、ライオネルがクロエの調査を阻む。
レックスは、隕石の影響で不思議なパワーを持つものを集め、彼らに実験をしていたのだ。
その施設から脱獄した男が、レックスを拉致したのだが、彼は違う周波数を行き来できるという力を持っており、レックスはその違う周波数の中に閉じ込められているという。
その男の目的はレックスに施設の存在を認めさせること。
しかし認めないレックスに対し、男はラナに施設の存在を見せようとしたが、
その施設は既に跡形もなく消えていた。
ことの真相を聞いたラナは、ジミーとクロエに頼み、周波数の中からレックスを連れ出そうと試みる。
一方で、男はレックスに詰め寄り、施設をどこにやったかを聞くが、レックスは知らないという。
どうやらライオネルが手を打った様子。
男はこれではらちがあかんと思い、ラナを拉致してくるが、レックスともみ合いになり、男は死亡した。
ラナは改めてレックスの大切さを実感し、妊娠したことも伝える。
とっても喜んだレックスはラナにプロポーズしました。
その頃、クラークはというと、ナゾの事件現場に行っておりました。
そこでは船の乗組員多数が、骨を抜かれた状態で死亡しているという。
現場で飛び散っているのは骨髄・・・・。
おぞましい光景・・・。
犯人は、やはり不思議なパワーを持った人間だったが、ファントムではなかった。
あっさりその男に投げ飛ばされたクラークは、ヤツに歯が立たない・・・。
しかしそこに、さらにナゾの男が現れてクラークを助けてくれる。
目だけが光る彼は、ビューーーーンと空に飛んでいってしまう。
敵か見方か？
はたまた天使か？
（スーパーナチュラルかぃっ？）