記事にリンクさせてありますので、リストの神社名をクリック (またはタップ)頂ければ御朱印の画像が見られます。
【 北海道 ・ 東北 】
北海道
北海道神宮 蝦夷国一之宮
北海道神宮頓宮
開拓神社
札幌三吉神社
琴似神社 (屯田一之宮)
岩見澤神社 (石狩国一之宮)
網走神社 (北見国一之宮)
徳山大神宮 (渡島国一之宮)
姥神大神宮 (渡島国一之宮)
函館八幡宮
船魂神社
北門神社
出雲大社 網走教会
出雲大社 三神教会
青森県
岩木山神社奥宮 津軽国一之宮
岩木山神社津軽国一之宮
出雲大社 弘前分院
岩手県
駒形神社 陸中国一之宮
駒形神社奥宮 陸中国一之宮
秋田県
太平山三吉神社奥宮
太平山三吉神社総本宮
宮城県
鹽竃神社と志波彦神社 陸奥国一之宮
蔵王刈田嶺神社奥宮
黄金山神社
山形県
鳥海山大物忌神社 御本社 出羽国一之宮
鳥海山大物忌神社 口之宮 出羽国一之宮
鳥海御浜神社
出羽三山神社 三神合祭殿
月山神社 本宮
御田原神社 月山中之宮
湯殿山神社 本宮
福島県
伊佐須美神社 岩代国一之宮
石都々古別神社 陸奥国一之宮
都々古別神社(八槻) 陸奥国一之宮
都々古別神社(馬場) 陸奥国一之宮

【 関 東 】
東京都
大國魂神社  武蔵総社
小野神社  武蔵一之宮
明治神宮
日枝神社
東京大神宮
神田神社
浅草神社
羽田神社
武蔵御嶽神社
出雲大社 東京分祠
タワー大神宮 幸稲荷神社 境外末社
神奈川県
大山阿夫利神社 本社
大山阿夫利神社 下社
大山阿夫利神社 社務局
箱根元宮
箱根神社
箱根 九頭龍神社
公時神社(金時神社)
鶴岡八幡宮 相模国一之宮
寒川神社 相模国一之宮
川勾神社 相模国二之宮
比々多神社 相模国三之宮
江島神社
龍口明神社
出雲大社 相模分祠
埼玉県
氷川神社 武蔵国一之宮
氷川女體神社 武蔵国一之宮
中山神社 氷川簸王子神社
秩父神社 知知夫国一之宮
宝登山神社
宝登山神社奧宮
三峯神社
三峯神社奥宮
群馬県
貫前神社 上野国一之宮
二宮赤城神社 上野国二之宮
赤城神社(三夜沢) 本宮
赤城神社(大洞) 元宮
榛名神社
妙義神社
中之獄神社
中之嶽大国神社 
栃木県
宇都宮二荒山神社 下野国一之宮
日光二荒山神社 奥宮 下野国一之宮
→男体山登拝大祭の御朱印(各種)
日光二荒山神社 中宮祠 下野国一之宮
日光二荒山神社 本宮 下野国一之宮
本宮神社 二荒山神社別宮
瀧尾神社 二荒山神社別宮
日枝神社 二荒山神社末社
朋友神社 二荒山神社末社
北野神社 二荒山神社末社
大国殿 二荒山神社摂社
神 橋 二荒山神社
華厳神社 二荒山神社中宮祠末社
日光湯元温泉神社
日光東照宮
茨城県
鹿島神宮本宮 常陸国一之宮
鹿島神宮奥宮 常陸国一之宮
筑波山神社
筑波山神社 御本殿
出雲大社 常陸教会
千葉県
安房神社 安房国一之宮
洲崎神社 安房国一之宮
香取神宮 下総国一之宮
玉前神社 上総国一之宮

【 甲信越 ・ 北陸 】
新潟県
弥彦神社 御神廟(奥宮) 越後国の一之宮
弥彦神社 越後国の一之宮
居多神社 越後国の一之宮
度津神社 佐渡国の一之宮
八海山尊神社
富山県
高瀬神社 越中国一之宮
気多神社 越中国一之宮
射水神社 越中国一之宮
雄山神社 峰本社 越中国一之宮
雄山神社 中宮祈願殿 越中国一之宮
雄山神社 前立社壇 越中国一之宮
石川県
気多大社 能登国一之宮
白山比咩神社 白山本宮 加賀国一之宮
白山比咩神社奥宮 加賀国一之宮
福井県
氣比神宮 越前国一之宮
若狭彦神社 若狭国一之宮
若狭姫神社 若狭国二之宮
長野県
諏訪大社 上社本宮信濃国一之宮
諏訪大社 上社前宮 信濃国一之宮
諏訪大社 下社秋宮 信濃国一之宮
諏訪大社 下社春宮 信濃国一之宮
戸隠神社 奥社
戸隠神社 中社
戸隠神社 宝光社
戸隠神社 九頭龍社
戸隠神社 火之御子社
穂高神社 本宮
穂高神社 奥宮
穂高神社 嶺宮
山家神社 本宮
山家神社 中宮
山家神社 奥宮(東之宮・巌窟・西之宮)
山家神社 奥宮(四阿山寶印)
根子岳神社 (禰固嶽霊社)
木曽駒ヶ岳神社
御嶽神社 黒沢口(里宮と御嶽山頂上)
御嶽神社 大滝口(里宮から頂上まで各種)
山梨県
浅間神社 甲斐国一之宮
富士山小御岳神社
北口本宮 冨士浅間神社
新倉富士浅間神社
富士山下宮 小室浅間神社
北東本宮 小室浅間神社
小明見 冨士浅間神社
忍草浅間神社
河口浅間神社
冨士御室浅間神社 里宮
冨士御室浅間神社 本宮
無戸室浅間神社(船津胎内神社)
山中浅間神社
新屋山神社奥宮
新屋山神社本宮
甲斐駒ヶ嶽神社 竹宇前宮
甲斐駒ヶ嶽神社 横手前宮
金桜神社 里宮
金櫻神社 本宮

【 東 海 】
静岡県
富士山本宮 浅間大社 駿河国一之宮
富士山本宮 浅間大社奥宮 駿河国一之宮
→浅間大社奥宮の御朱印の種類
浅間大社東北奥宮 久須志神社
富士山東表口参道宮 新橋浅間神社
富士山東口本宮 冨士浅間神社
富士山東口 一幣司浅間神社
富士山南口下宮 須山浅間神社
富士根本宮 村山浅間神社
富士山元宮 山宮浅間神社
人穴浅間神社
城山富士浅間神社
米之宮浅間神社
富知六所浅間神社(三日市浅間神社)
沼津 日吉浅間神社
沼津浅間神社・丸子神社
駒門浅間神社
静岡浅間神社
久能山東照宮
三嶋大社 伊豆国一之宮
伊豆山神社
来宮神社
曽我浅間神社
伊古奈比咩命神社(白濱神社)
石室神社
大瀬神社
沼津日枝神社
沼津 城岡神社
割狐塚稲荷神社
秋葉山本宮秋葉神社 上社
秋葉山本宮秋葉神社 下社
小國神社 遠江国一之宮
事任八幡宮 遠江国一之宮
見付天神 矢奈比賣神社
桜ヶ池 池宮神社
愛知県
熱田神宮
真清田神社 尾張国一之宮
大神神社 尾張国一之宮
津島神社 天王総本社
砥鹿神社 奥宮 三河国一之宮
砥鹿神社 里宮 三河国一之宮
岐阜県
南宮大社 美濃国一之宮
水無神社 飛騨国一之宮
乗鞍本宮 本社(頂上本殿)
乗鞍本宮 中之社
三重県
多度大社
敢國神社 伊賀国一之宮
椿大神社 伊勢国一之宮
椿岸神社
都波岐神社 伊勢国一之宮
伊射波神社 志摩国一之宮
二見興玉神社
猿田彦神社・佐瑠女神社

伊 勢 神 宮
内宮 (皇大神宮)
外宮 (豊受大神宮)
月讀宮 内宮別宮
瀧原宮 内宮別宮
伊雑宮 内宮別宮・志摩国一之宮
倭姫宮 内宮別宮
月夜見宮 外宮別宮

【 近 畿 】
京都府
上賀茂神社 山城国一之宮
下鴨神社 山城国一之宮
出雲大神宮 丹波国一之宮
籠神社 丹後国一之宮
平安神宮
北野天満宮 天満宮総本社
貴船神社
八坂神社
京都ゑびす神社
京都大神宮
晴明神社
宇治上神社
宇治神社
石清水八幡宮

伏見稲荷大社
伏見稲荷大社 奥社奉拝所と御膳谷奉拝所

愛宕神社 総本宮
愛宕神社 [千日詣] 本社・奥宮・若宮
出雲大社 京都分院
滋賀県
建部大社 近江国一之宮
日吉大社
大阪府
住吉大社 摂津国一之宮
坐摩神社 摂津国一之宮
大鳥大社 和泉国一之宮
枚岡神社 河内国一之宮
奈良県
大神神社 大和国一之宮
屋坐弥冨都比売神社 大神神社別宮
春日大社
龍田大社
談山神社
石上神宮
橿原神宮
玉置神社
和歌山県
日前神宮・國懸神宮 紀伊国一之宮
伊太祁曽神社 紀伊国一之宮
丹生都比売神社 紀伊国一之宮
熊野本宮大社
阿須賀神社
熊野速玉大社
神倉神社
熊野那智大社
那智の滝 (飛瀧神社)

兵庫県
伊弉諾神宮 淡路国一之宮
西宮神社 えびす宮総本社
出雲大社 神戸分祠
伊和神社 播磨国一之宮
出石神社 但馬国一之宮
粟鹿神社 但馬国一之宮

【 中 国 】
島根県
出雲大社 出雲国一之宮
出雲大社 神楽殿
出雲大社 北島国造館
熊野大社 出雲国一之宮
美保神社
須佐神社
須我神社
佐太神社
八重垣神社
神魂神社
日御碕神社
玉造湯神社
物部神社 石見国一之宮
由良比女神社 隠岐国一之宮
水若酢神社 隠岐国一之宮
玉若酢命神社
鳥取県
倭文神社 伯耆国一之宮
大神山神社 本社
大神山神社 奥宮
宇部神社 因幡国一之宮
白兎神社
岡山県
吉備津彦神社 備前国一之宮
石上布都魂神社 備前国一之宮
吉備津神社 備中国一之宮
中山神社 美作国一之宮
岡山神社
岡山縣護國神社
備前国総社宮
備中国総社宮
玉井宮東照宮
龍之口八幡宮
出雲大社 岡山分院
広島県
厳島神社 安芸国一之宮
吉備津神社 備後国一之宮
素盞嗚神社 備後国一之宮
出雲大社 広島分祠
山口県
玉祖神社 周防国一之宮
住吉神社 長門国一之宮

【 四 国 】
徳島県
大麻比古神社 阿波国一之宮
剣山本宮宝蔵石神社
大剣神社
剣神社
香川県
田村神社 讃岐国一之宮
金比羅宮奥宮 巌魂神社
金比羅宮
愛媛県
大山祗神社 伊予国一之宮
石鎚神社 口之宮本社
石鎚神社 中宮成就社
石鎚神社 頂上本社
石鎚神社 土小屋遙拝殿
出雲大社 松山分祠
高知県
土佐神社 土佐国一の宮

【 九州 ・ 沖縄 】
福岡県
筥崎宮 筑前国一之宮
住吉神社 筑前国一之宮
櫛田神社
高良大社 筑後国一之宮
太宰府天満宮
英彦山神宮
宗像大社辺津宮
宗像大社中津宮
宗像大社沖津宮遥拝所
宗像大社沖津宮
出雲大社 福岡分院
佐賀県
與止日女神社 肥前国一之宮
千栗八幡宮 肥前国一之宮
大分県
宇佐神宮 豊前国一之宮
西寒多神社 豊後国一之宮
柞原八幡宮 豊後国一之宮
熊本県
阿蘇神社 肥後国一之宮
藤崎八幡宮
宮崎県
都農神社 日向国一之宮
高千穂神社
天岩戸神社
青島神社
鵜戸神宮
鹿児島県
新田神社 薩摩国一之宮
枚聞神社 薩摩国一之宮
鹿児島神宮 大隅国一之宮
霧島神宮
長崎県
天手長男神社 壱岐国一之宮
興神社 壱岐国一之宮
住吉神社
海神神社 対馬国一之宮
厳原八幡宮 対馬国一之宮
和多都美神社
沖縄県

波上宮 琉球国一之宮
沖宮
出雲大社 沖縄分社

【 海 外 】
布哇州
出雲大社 布哇分院