chooseCRANmirror(graphics=F)
Linuxの導入から解析まで。
超初心者的備忘録。
chooseCRANmirror(graphics=F)
矢内氏の説明に基本的に従う。
$sudo apt-key adv --keyserver
keyserver.ubuntu.com --recv-keys
E298A3A825C0D65DFD57CBB651716619E084DAB9
$ sudo add-apt-repository 'deb https://cloud.rproject.org/bin/linux/ubuntu focal-cran40/'
のところはproxyを突破できないかもしれない。
そこで
を拝見。
同ブログの説明に従って、
に
0xE298A3A825C0D65DFD57CBB651716619E084DAB9
と入力する。
取得した.acrファイルを丸ごと保存する。
(-----BEGIN PGP PUBLIC KEY BLOCK-----
Comment: Hostname:
Version: Hockeypuck 2.1.1-10-gec3b0e7の部分の含めて丸ごと保存。)
サイト説明通りに、
cat hoge.txt | sudo apt-key add -
を行い、その後矢内氏の説明に戻って、
sudo add-apt-repository 'deb https://cloud.rproject.org/bin/linux/ubuntu focal-cran40/'
を行う。
これでRがインストールされる。
R-studio serverのインソールは
に従う。
さらに
に従って,~/.Rprofileと~/.Renvironにproxy情報及び、curlの記入を行う。
/opt/ont/guppy/data
watch -d -n 0.5 nvidia-smi
0.5秒おきに変化したパラメータをハイライトする。
vContact2をインストール
Python=3.7.3だと動く。
3.11だと動かなかった。
--c1-bin /path/to/cluster_one-1.0.jar
のオプションをつけてrunする。
まず基本的なこととして
install.packages('phangorn', Dependency = T)
のようにDependencyのインストールも一緒に行う。
libgfortran.so.4: 共有オブジェクトファイルを開けません: そのようなファイルやディレクトリはありません
と怒られた。
sudo apt install gfortran-7
をしてみる。。。
その後再度
install.packages('phangorn', Dependency = T)
したら解決。
apeのインストールでは、
/usr/bin/ld: cannot find -llapack
/usr/bin/ld: cannot find -lblas
と怒られたが、これは
sudo apt-get install libblas-dev liblapack-dev
sudo apt-get install libgsl0-dev
を行ったら、解決した。
何をやっているのか自分で分からない。。。