３回戦
10月７日（日）
水戸 １―０ ツエーゲン金沢 13:00 笠松
湘南 ３―０ Ｖ・ファーレン長崎 13:00 平塚
佐川急便ＳＣ ４―０ バンディオンセ神戸 13:00 佐川守山
山形 ３―０ 鹿屋体育大 13:00 ＮＤスタ
徳島 ２―０ ＦＣ岐阜 13:00 鳴門大塚
愛媛 １―０ 沖縄かりゆしＦＣ 13:00 愛媛陸
札幌 １―１(PK 9-10) ＴＤＫ 13:00 札幌厚別
福岡 ４―０ 栃木ＳＣ 13:00 博多球
鳥栖 １―０ 筑波大 13:00 佐賀
東京Ｖ ０―１ ホンダＦＣ 13:00 味スタ
仙台 １―２ 順天堂大 13:00 ユアスタ
草津 ０―０(PK 5-4) アローズ北陸 13:00 群馬陸
京都 ０―１ 明治大 13:00 西京極
Ｃ大阪 ４―２ ホンダロック 13:00 長居２
４回戦
11月４日（日）
千葉 １―３ 大分 13:00 フクアリ
清水 ３―３(PK 5-4) 明治大 13:00 日本平
横浜 ４―１ 佐川急便ＳＣ 13:00 三ツ沢
新潟 ２―３ 鳥栖 13:00 東北電ス
ＦＣ東京 ２―１ ＴＤＫ 13:00 味スタ
磐田 ６―１ 順天堂大 13:00 ヤマハ
広島 ３―０ 湘南 13:00 鳥取
大宮 ０―２ 横浜ＦＣ 13:00 富山
神戸 ２―０ 福岡 13:00 ホムスタ
鹿島 ２―０ 水戸 13:00 カシマ
甲府 ３―１ 徳島 13:00 小瀬
柏 ２―３ ホンダＦＣ 13:00 柏
名古屋 ３―１ 草津 13:00 瑞穂陸
11月７日（水）
Ｇ大阪 ２―２(PK 5-3) 山形 19:00 万博
川崎Ｆ ３―０ Ｃ大阪 19:00 等々力
11月28日（水）
浦和 ０―２ 愛媛 19:00 駒場
５回戦
12月８日（土）
鳥栖 １―２ ＦＣ東京 13:00 丸亀
鹿島 ２―１ 甲府 13:00 カシマ
ホンダＦＣ ２―０ 名古屋 13:00 松江
清水 ５―３ 横浜 13:00 岡山陸
Ｇ大阪 ３―１ 大分 13:00 フクアリ
神戸 ０―３ 川崎Ｆ 13:00 神戸ユ
愛媛 ２―１ 横浜ＦＣ 13:00 長崎
12月15日（土）
磐田 ０―２ 広島 13:00 広島ビ
準々決勝
12月22日（土）
Ｇ大阪 １―０ 清水 13:00 長居
鹿島 １―０ ホンダＦＣ 15:00 ユアスタ
12月23日（日）
愛媛 ０―２ 川崎Ｆ 13:00 埼玉
ＦＣ東京 ０―２ 広島 15:00 熊本陸
準決勝
12月29日（土）
Ｇ大阪 １―３ 広島 13:00 エコパ
川崎Ｆ ０―１ 鹿島 15:00 国立
決勝
１月１日（火）