シンプルで直観的に操作できる重複ファイルのGUI検索ツールが「FSlint」です。
Ubuntu で動作するFSlintは、Synapticパッケージマネージャーから「fslint」で検索するだけでインストールできます。
FSlintを起動したら、「Search path」タブに重複ファイルを検索するフォルダを追加する。
デフォルトではホームフォルダが登録されていますが、重複ファイルを探すフォルダを別に指定したいときは、「Remove」ボタンでホームフォルダを削除して、「Add」ボタンで検索対象のフォルダを追加します。
画面左下の「Find」ボタンをクリックすると、指定したフォルダ内の重複ファイルが検索され検索結果が表示されます。
重複ファイルはその中身が比較されるので、ファイル名が異なっても同じファイルなら検出されます。
あとは、リストから削除したい重複ファイルを選択して、「Delete」ボタンで削除する。