自分も今では，ほとんどUbuntu Linuxばっかり使ってるが，もともとはFreeBSDユーザーだった．
前の高専で，何故かFreeBSDのports管理に使うポートをどうしても開けてもらえず，泣く泣くLinuxへ移行した．
セキュリティ上でもなんにも問題が無いポートなんだが，情報管理センターの先生が，Microsoft大好き人間だったので，必要性が全く解らなかったのだろう．説明するのに疲れてしまった・・・
最近，あんまり話題にならなくなったFreeBSDであるが，開発はまだまだ続いているし，仕事でサーバーを作れ！って言われたら，迷わずFreeBSD一択ですね．
Kernelのカスタマイズも楽だし，余分なものがインストール時に入らないとこが利点で，システム全体を把握できる．ネットワーク系もコードが優秀だから安心できるし・・・
自分が使ってるsakura internetも確かサーバーは，FreeBSDだったと思う．
Linuxでサーバー用途のdistributionっていったら，CentOSが定番だったが，もう無くなってしまった．また学校でメンテナンスしていた並列計算機がCentOSだったが，意外とメンテナンスが面倒くさいことが判明して，もうあんまり触りたくない．
サーバーみたいに特殊な用途でないなら，やっぱりUbuntu が楽だと思ってしまう．
セキュリティなんて，ある程度やっとけば良いし，Nvidia社のGPUの導入も面倒くさくないし，アプリのインストールとか環境構築も手抜きができる(笑)
CentOSは，GPUとの相性が最悪で，Kernelが更新される度に面倒くさい手順で，モジュールをビルドしなければ動かないから，参ったなぁ・・・