ツールスレ４６のレス719で指摘があり、レス721で対応方法が回答されています。
自分の場合、盟主城等の敵襲監視を入れているので、これだけでは表示が改善されませんでしたので、下記の対策をしました。
修正後の map 表示
１．#map_statusbox の調整（1ヶ所）
レス721の内容
$('#map_textarea, #map_statusbox').css('margin-top', '30px');
２．#MapContentWrap の調整（３ヶ所）
- $('#MapContentWrap').css( { 'height' : 'auto', 'min-height' : '1020px' } );
+ $('#MapContentWrap').css( { 'height' : 'auto', 'min-height' : '1100px' } );
$('#moko_map_control_box').after(html);
- $('#MapContentWrap').css({ 'height': 'auto', 'min-height': '900px' });
+ $('#MapContentWrap').css({ 'height': 'auto', 'min-height': '1100px' });
// 地図画面レイアウト
- '#MapContentWrap { height:auto; min-height: 800px; }' +
+ '#MapContentWrap { height:1100px; }' +
３．その他の調整
// 地図画面レイアウト
'#MapContentWrap { height:1100px; }' +
+ 'div.new_worldmap_block { height: 769px; }' +
+ '#map_statusbox.new_worldmap_map_statusbox_s11 { top: 0px; }' +
+ '#act_battle_data.new_worldmap_act_battle_data_s11 { top: 0px; }' +
以上