PAN AMは、第二次世界大戦が終結した2年後の1947年に東京国際空港（羽田空港）に乗り入れを開始した。以降、成田国際空港をアジアにおけるハブ空港とし、アメリカの各都市やグアム、サイパンからの便の乗り入れだけでなく、香港、シンガポール、バンコクおよびサイゴンなどのアジア各地や、さらには、羽田空港や成田空港にボーイング727型機やボーイング707型機を常駐させ、大阪国際空港（伊丹空港）などへの乗り継ぎ便の運航など路線を広げていった。東京はPAN AM自慢の世界一周路線の寄港地であった他、1959年には初の本格大型ジェット機であるボーイング707型機を東京-サンフランシスコ線に就航させたほか、1976年にはボーイング社に特注した超長距離型のボーイング747-SP型機により世界初のニューヨーク-東京間の無着陸直行便を就航させるなど、当時のパンナムにとって日本は非常に重要な寄港地であり、収益源であった。
しかし経営不振を打開するための運転資金調達のために、1985年に太平洋路線と社員、機材をユナイテッド航空に売却し日本路線から撤退した。千代田区有楽町にあった東京支店は、1991年12月にパンナム全路線の運航が停止されるまで営業を行っていた。