ラジマ火山の温泉によりすっかり傷も癒え更に強化の石により強くなったレヴィアタンは神殿内のルーカサイトを倒し元の姿に取り戻すす為にバハムートとヨルムンガンドとシロップで遺跡に戻って来ます
そして４人は行く手を阻む大量のトリプを駆け抜け神殿に着きます
そこにはルーカサイトが神殿の結界を破ろうとして４人は対峙します
一方水を探しに来たメタル・ルドラ・ラゴンはカエルの石像を見付けて取れている目を着けるとそこから水が沸きだします
同じ頃レヴィアタンとバハムートとヨルムンガンドは３人でルーカサイトに戦います
だが３人の攻撃が噛み合わずバハムートとヨルムンガンドが倒れて危機的な状態になりレヴィアタンはルーカサイトは追い込まれます
するとそこでレヴィアタンが進化してヨルムンガンドとの連携でルーカサイトを倒します
その後４人はヘケトとメタル・ルドラ・ラゴンに出会し３人が瀕死のヘケトに水を汲んであげてヘケトは３人の助けで結界を張れたと話します
そして４人がヘケトと別れて少し歩くと謎の少年が
｢ルーカサイトを倒してくれてありがとう｣
との声の後に遺跡が元の姿を取り戻し浮き島が現れるのだった
という展開です