倫太郎は鈴羽から第３次世界大戦を止める事を言われラジ館の屋上に至とまゆりで向かうとそこにはタイムマシンが有った
鈴羽は倫太郎に第３次世界大戦を阻止するべく一緒に２０３６年に来る様に伝えます
倫太郎は最初は今までの苦労と紅莉栖の犠牲を無駄にしたくないという思いから行く事を拒みます
だが鈴羽は戦争を阻止すれば牧瀬紅莉栖を死なさずに済み
その為には未知の世界線シュタインズゲートに向かわなければいけないと伝えます
そして倫太郎はまゆりと至の後押しを受け携帯をまゆりに預け鈴羽と共にタイムマシンに乗り紅莉栖が刺された日付に飛びます
倫太郎は早速紅莉栖の殺した犯人が誰か探りますがそこには中鉢博士だった…
紅莉栖は父親の中鉢博士にタイムマシンの論文を見せますがそれを自分の論文として発表すると言ってもみ合いになり刺されたのだ…
倫太郎は紅莉栖を守ろうとして体を張りますが
倫太郎は中鉢博士ともみ合って紅莉栖を刺してしまいます
鈴羽は一度倫太郎を連れ現代に戻りますが
倫太郎は自分が紅莉栖を殺した事に深い罪悪感に襲われ強い失望感にさいなまれます
すると倫太郎の携帯に
｢テレビを見ろ｣
というメールが
早速至が携帯のテレビを見ると
そこにはロシアに亡命した中鉢博士の姿が
鈴羽は中鉢博士の持っていた紅莉栖のタイムマシンの論文から大国間でタイムマシン開発競争になりそこで第３次世界大戦に発展したと倫太郎は言います
鈴羽は紅莉栖を助け人口５３億人を救って欲しいと頼みます
だが倫太郎はまゆりの事で相当参って自信を無くしていた
するとまゆりはそんな倫太郎に平手打ちを食らわし
｢おかりんは諦めない人だからちゃんとお婆ちゃんとお別れできたんだよ。だから諦めちゃダメ｣
と伝えます
そして倫太郎は鈴羽に促され７月２８日に届いたムービーメールを見ると
そこには十五年前の倫太郎の姿が
十五年前の倫太郎は今の倫太郎に牧瀬紅莉栖を救いシュタインズゲートに入る計画を語ります
その条件は２つで
１つは中鉢博士のタイムマシンの論文を闇に葬る事
２つ目は牧瀬紅莉栖が死んだ過去を無にせず倫太郎の歩んで来た事を受け入れ世界を騙して紅莉栖を救う事を伝えます
そして倫太郎はいつものマッドサイエンティストに戻り最後の戦いに向かうのだった
という展開です