地球と生命の起源と歴史、更に、人類への進化についてです。【…
地球と生命の起源【概略】地球と生命の起源と歴史、更に、人…
地球と生命の進化【概説】地球と生命の起源と歴史、更に、人類…
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成分の起源は、タンパク質？糖？植物の細胞壁、菌類の細胞壁、真正細菌の細胞壁、古細菌の細胞壁 参考、セルロース、キチン、ペプチドグリカン、S層とシュードムレイン、ペリプラズム、ジアミノピメリン酸
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膜だけだった？原始生命体。リン脂質、膜タンパク質（内在性膜タンパク質・表在性膜タンパク質）、糖鎖 参考、分泌、イオノフォア、非リボソームペプチド
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細胞の形態維持や運動に関わる小器官。 真核生物の細胞骨格（アクチンフィラメント・中間径フィラメント・微小管）、原核生物の細胞骨格（アクチン様タンパク・クレセンチン・FtsZ） 参考、アクチン、チューブリン、分子クラウディング効果、アナログ、ホモログ
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起源はRNA ポリメラーゼ？リボソーム、リボソームRNA、リボソームタンパク質 参考 、RNAポリメラーゼ、沈降速度
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タンパク質や脂質等の合成工場。粗面小胞体、滑面小胞体 参考、シトクロム、シトクロムP450、小胞体ストレス、ユビキチン、プロテアソーム
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糖鎖付加工場。ゴルジ体（シスゴルジ網・ゴルジ層板（シス嚢・中間嚢・トランス嚢）・トランスゴルジ網）、ゴルジ小胞と小胞輸送、 ゴルジ体の機能（タンパク質の修飾・多糖類の合成・低分子化合物の分泌・タンパク質の選別） 参考、グリコシル化（N-結合型 ・ O-結合型 ・ GPIアンカー ・ C-マンノシル化）、メイラード反応
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細胞の消化器官。リソソーム、エンドサイトーシス（飲作用・食作用）、エキソサイトーシス、エンドソーム、クラスリン、 オートファジー（マクロオートファジー・ミクロオートファジー・シャペロン介在性オートファジー・プログラム細胞死）、液胞
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遺伝情報の保存場所。核膜、核膜孔、核質、核小体、クロマチン、ラミン 参考、核様体、プラスミド
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真核生物のエネルギー産生器官となったバクテリア。ミトコンドリアの起源（ペラジバクター）、構造（外膜・膜間腔・内膜・マトリックス）、 機能（エネルギー産生（クエン酸回路・電子伝達系・β酸化）・熱産生・アポトーシス・カルシウム貯蔵）、ミトコンドリアゲノム 参考、アーケゾア、ステロイド、ヘム、リンゴ酸、グリオキシル酸、ミトコンドリアのシャトル系、 アミノ基転移、S-アデノシルメチオニン、メチルトランスフェラーゼ、ペルオキシソーム、細胞融合
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光合成を行う小器官。葉緑体の起源、形状、機能、藻類の葉緑体 参考、ピレノイド、カルボキシソーム、盗葉緑体現象
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細胞膜ワールド。膜電位の原理：静止電位の形成・イオン分布の差を引き起こす要素（イオンポンプによる移動・イオンチャネルによる移動・ 膜電位そのものによるもの）、平衡電位、静止膜電位、脱分極と過分極、ナトリウム-カリウムポンプ、カリウム漏洩チャネル
活動電位： 活動電位の仕組み（静止電位・刺激・脱分極・ピーク・再分極・過分極・不応期・閾値・回路モデル）、 活動電位の伝導（無髄線維・有髄線維）、電位依存性Na+チャネル
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エネルギー代謝の起源？嫌気的解糖、硝酸塩呼吸、硫酸塩呼吸、炭酸塩呼吸、その他
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複合体IとII、複合体III、複合体IV（電子伝達：NADH→複合体I（プロトンポンプとキノンサイクルでプロトンを膜外に放出）→ ユビキノン（複合体II（コハク酸デヒドロゲナーゼ）でも生じます）→複合体III（スカラー反応）→シトクロムC（真正細菌はキノン）→ 複合体IV（プロトンポンプ、真正細菌はスカラー反応）→酸素（水が生成））、ATP合成酵素
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起源は、電子伝達系と解糖系？酸素が発生しない光合成もあります。光合成（酸素発生型・酸素非発生型・ロドプシン型）、葉緑体、 光化学反応（酸素発生型（非循環的電子伝達系（電子伝達：光（赤色）→PSII（キノン型。クロロフィル 680nm）→プラストキノン→シトクロムb6/f複合体→ プラストシアニン→PSI（鉄硫黄型。クロロフィル 700nm）→フェレドキシン→NADPH→CFo-CF1ATP合成酵素→光リン酸化）・循環的電子伝達系）・ 酸素非発生型（紅色細菌（PS IIに対応、電子伝達：光（赤外線）→P870（バクテリオクロロフィル）→ユビキノン→ シトクロムbc1複合体（呼吸鎖複合体III）→シトクロムc2→シトクロムオキシダーゼ（呼吸鎖複合体IV）→酸素）・ 緑色硫黄細菌（PS Iに対応、電子伝達：光（赤外線）→P840（バクテリオクロロフィル）→フェレドキシン→NAD+→呼吸鎖複合体I→メナキノン (ビタミンK2) →シトクロムbc1複合体（呼吸鎖複合体III) →シトクロムc→P840）・バクテリオロドプシン） カルビン回路（D-リブロース-1,5-ビスリン酸・ 3-ホスホグリセリン酸・2,3-ホスホグリセリン酸・1,3-ビスホスホグリセリン酸・ グリセルアルデヒド-3-リン酸・ジヒドロキシアセトンリン酸・セドヘプツロース-7-リン酸・リボース-5-リン酸・キシルロース-5-リン酸・ フルクトース-1,6-ビスリン酸・フルクトース-6-リン酸・エリトロース-4-リン酸） 参考、光受容体タンパク質（赤色：フィトクロム、青色：クリプトクロム・フォトトロピン、可視光線・紫外線・赤外線）、 ポリリン酸、ニトロゲナーゼ、亜硫酸酸化酵素、モリブデン、亜硫酸還元酵素、フェレドキシン
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エムデン・マイヤーホフ経路（ EM経路 ：グルコース・グルコース-6-リン酸・フルクトース-6-リン酸・フルクトース-1,6-ビスリン酸・ジヒドロキシアセトンリン酸 / グリセルアルデヒド3-リン酸・1,3-ビスホスホグリセリン酸・3-ホスホグリセリン酸・2-ホスホグリセリン酸・ホスホエノールピルビン酸・ピルビン酸 ）、 エントナー・ドウドロフ経路（ ED経路 ：グルコース・グルコース-6-リン酸・6-ホスホグルコン酸・2-ケト-3-デオキシ-6-ホスホグルコン酸・ ピルビン酸 + グリセルアルデヒド-3-リン酸）、 ペントースリン酸経路（ PP経路 ：グルコース-6-リン酸・6-ホスホグルコノ-1,5-ラクトン・6-ホスホグルコン酸・リブロース-5-リン酸・リボース-5-リン酸・ キシルロース-5-リン酸・グリセルアルデヒド-3-リン酸・セドヘプツロース-7-リン酸・フルクトース-6-リン酸・エリトロース-4-リン酸）
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クエン酸回路（オキサロ酢酸 + アセチルCoA・クエン酸・cis-アコニット酸・イソクエン酸・オキサロコハク酸・α-ケトグルタル酸・スクシニルCoA・ コハク酸・フマル酸・L-リンゴ酸）、還元的クエン酸回路
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メバロン酸経路 ：酢酸 → アセチルCoA（活性酢酸） → アセトアセチルCoA → HMG-CoA → メバロン酸 → 5-ホスホメバロン酸 → 5-ジホスホメバロン酸 → イソペンテニル二リン酸（ IPP ） → ジメチルアリル二リン酸（ DMAPP ） 非メバロン酸経路 ：ピルビン酸 ＋ グリセルアルデヒド- 3-リン酸 → DOXP → MEP → CDP-ME → CDP-MEP → MecPP → HMB-PP → IPP又は DMAPP イソペンテニル二リン酸（ IPP ）と、ジメチルアリル二リン酸（ DMAPP ）の合成経路 参考、プレニル化反応
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DNA複製と、その起源について。複製開始（イニシエーターによる巻き戻し・プライマー合成・親鎖への娘鎖伸長に関わるタンパク質の集合）、 伸長段階（リーディング鎖合成・ラギング鎖合成）、終結、 DNA複製酵素 ：ヘリカーゼ、プライマーゼ、DNA ポリメラーゼ、DNAトポイソメラーゼ、DNAリガーゼ、テロメラーゼ、逆転写酵素、リボヌクレアーゼ 参考、ローリングサークル型複製、複製フォーク、複製バブル、レプリコン、プライモソーム、複製装置(レプリソーム)、DNAクランプ、クランプローダー、 半保存的複製、半不連続的複製、リーディング鎖、ラギング鎖、岡崎フラグメント、一本鎖DNA結合タンパク質(SSB)、ニックトランスレーション、 よじれ解消機構（スイベル）、カテナン、脱カテナン化、末端複製問題
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遺伝子から、RNAを合成する反応。開始、伸長、終結 参考、アボーティブ転写産物
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mRNAの情報から、タンパク質を合成する反応。細菌の翻訳、真核生物の翻訳、古細菌の翻訳 参考、シャイン・ダルガノ配列
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DNA誕生や、DNAとタンパク質のコラボの立役者？DNAメチル化（ほ乳類、植物、真菌、細菌）、エピジェネティクス
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創発現象からなる生命。相互作用 参考 ： 創発、グラフ理論（有向グラフ・無向グラフ・頂点と辺・重み付きグラフ・接合と隣接・距離と直径・ループと多重グラフ・部分グラフと親グラフ・次数と正則グラフ・ ウォークとサイクル・完全グラフとクリーク）、スモール・ワールド現象（六次の隔たり現象：エルデシュ数・ベーコン指数、 スケールフリーネットワーク・ブロードスケールネットワーク・シングルスケールネットワーク）、超伝導、フォノン
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エネルギーや物質をやり取りする場。 界面について 界面、吸着（物理吸着・化学吸着）、表面科学（表面とバルク・ミラー指数・ダングリングボンド）、真空（真空ポンプ）、単結晶
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生物間の相互作用。生物群集、ニッチ（棲み分け、競争排除、食い分け）、遷移、食物連鎖（食物網）、ロトカ＝ヴォルテラの方程式
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ハチやアリの社会はすごい。真社会性生物、真社会性の定義、真社会性の進化：前段階（亜社会性・側社会性）・社会性の進化・社会性昆虫の繁栄、 分類：ハチ目・シロアリ目・カメムシ目・コウチュウ目・アザミウマ目・十脚目（テッポウエビ科）・哺乳類（ハダカデバネズミ）・群体、群れの運営
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成長と生殖のサイクル。規則的な生活環（単相単世代型・複相単世代型・単複世代交代型・特殊な型）、 可変的な生活環（単為生殖・相変異・幼生による生殖）、体細胞分裂、減数分裂、染色体（姉妹染色分体、相同染色体、二価染色体）
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元々は、DNA修復や外来DNAの取り込みのため？ 有性生殖（配偶子、有性生殖の意義、有性生殖のパラドックスに対する仮説：マラーのラチェット・環境に適応するスピード・コンドラショフの効果・赤の女王仮説）、 接合（一般型、特殊型、繊毛虫、細菌）、プラスミド
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一つの細胞が二つの細胞になる周期。細胞周期の制御（細胞周期エンジン、細胞周期チェックポイント）、間期（G1期・S期・G2期）、 M期（分裂期）、静止期(G0期) 、チェックポイント（G1/Sチェックポイント、S期チェックポイント、G2/Mチェックポイント、M期チェックポイント） 参考、ユビキチン、シャペロン、p53遺伝子、Rb遺伝子、BRCA1遺伝子
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核酸とタンパク質をつなぐ暗号。核酸、タンパク質、コードの翻訳、コードの共通点、コドン表、アミノ酸の採用
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RNAとアミノ酸をつなぐ、アダプター。tRNA、アミノアシルtRNA合成酵素 参考、タンパク質の構造（一次から四次構造、モチーフ、ドメイン、フォールディング、アンフィンセンのドグマ、ロイシンジッパー・Znフィンガー） 二次構造 ：ヘリックス（αヘリックス、βヘリックス、コラーゲンヘリックス等）、平面構造（βシート、βヘアピン、βバルジ、αシート、ターン）、 超二次構造（コイルドコイル、ヘリックスターンヘリックス、EFハンド） 三次構造 ：αフォールド（ヘリックスバンドル、グロビンフォールド、ホメオドメインフォールド、αソレノイド）、 βフォールド（免疫グロブリンフォールド、βバレル、βプロペラドメイン）、 α/βフォールド（TIMバレル、ロイシンリッチリピート、フラボドキシンフォールド、チオレドキシンフォールド、三葉結び目フォールド）、 α+βフォールド（フェレドキシンフォールド、リボヌクレアーゼA、SH2ドメイン）
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タンパク質や、脂質等をつなぐ物質。アセチルCoA、ピルビン酸デヒドロゲナーゼ複合体、 補酵素A（アセチルCoA以外の誘導体：アセトアセチルCoA、HMG-CoA、プロピオニルCoA、マロニルCoA、スクシニルCoA）、ピルビン酸 参考、チオエステルワールド、 ビタミンB群 ：チアミン（B1）、リボフラビン（B2。FAD）、ナイアシン（B3。NAD）、パントテン酸（補酵素A）、 ピリドキシン（B6）、ビオチン（B7）、葉酸（テトラヒドロ葉酸）、シアノコバラミン（B12） 複素環式化合物 ：ピロール、ホスホール、フラン、チオフェン、イミダゾール、オキサゾール、チアゾール、 ピリジン、ピリダジン、ピリミジン、ピラジン、プテリジン、プリン、インドール
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ウィキペディア
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よくわかる微生物学の基本としくみ（秀和システム）
身近な数学の記号たち（オーム社）、
身近な物理の記号たち（オーム社）、
理系総合のための生命科学（羊土社）、等