ピーチ・バニラ・ジェットスター LCCは基本的に振替になることはありません。
なので、払い戻しをして、新しいチケットを購入するということになります。
せっかく格安で購入できたとしてもその時点のチケット代金になるので3,000円で購入できたとしても欠航になった場合は、空席がある場合にその時点の価格が20,000円であればそれを購入するしかないということになります。
LCCを乗る場合はこのようなリスクがあります。
札幌~東京の場合は現在はジェットスターのみ (2014年1月29日からはバニラエアが就航します。)
札幌~関空の場合はピーチが多く便があります。ジェットスターは1日1便です。
以上のことを理解した上で予約しましょう。
これは公式の情報ではありませんが、ジェットスターの場合は振替便になったとしても、追加料金は取られたことは今までありません。そして、JALにも振替る場合もあるようです。
あくまで、私の体験談です。公式ではないですよ。
なので、ジェットスターがオススメです。

次の記事はフルサービスのエアラインについて説明します。
http://ameblo.jp/hankoya21/entry-11739752423.html