タンパク分子量手計算
| ■タンパク・アミノ酸の分子量の手計算
タンパク・アミノ酸の分子量を計算でするには、アミノ酸の分子量表を利用する。 たとえば、右図のようなグリシンのジペプチドの分子量は、グリシンの分子量７５．０７および水の分子量１８．０２から計算する。 ペプチド結合により水分子が引かれるからだ。
７５．０７ ＋ ７５．０７ － １８．０２ ＝ １３２．１２
タンパクのアミノ酸の配列より、グリシン、アラニンのアミノ酸の数がわかり、それからタンパクの分子量が手計算することができる。
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蛋白質を構成する主なアミノ酸
分類
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和名/英語名
(略号/1文字略号) |
分子式
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分子量
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中
性
ア
ミ
ノ
酸
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脂肪族
アミノ酸
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グリシン/Glycine
(Gly/G)
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C2H5NO2
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75.07
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アラニン/Alanine
(Ala/A)
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C3H7NO2
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89.09
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バリン/Valine
(Val/V)
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C5H11NO2
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117.15
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ロイシン/Leucine
(Leu/L)
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C6H13NO2
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131.18
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イソロイシン/Isoleucine
(Ile/I)
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C6H13NO2
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131.18
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オキシ
アミノ酸
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セリン/Serine
(Ser/S)
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C3H7NO3
|
105.09
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トレオニン/Threonine
(Thr/T)
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C4H9NO3
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119.12
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含硫
アミノ酸
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システイン/Cysteine
(Cys/C)
|
C3H7NO2S
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121.15
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シスチン/Cystine
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C6H12N2O4S2
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240.30
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メチオニン/Methionine
(Met/M)
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C5H11NO2S
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149.21
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芳香族
アミノ酸
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フェニルアラニン/
Phenylalanine (Phe/F)
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C9H11NO2
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165.19
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チロシン/Tyrosine
(Tyr/Y)
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C9H11NO3
|
181.19
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トリプトファン/Tryptophan
(Trp/W)
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C11H12N2O2
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204.23
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イミノ酸
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プロリン/Proline
(Pro/P)
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C5H9NO2
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115.13
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酸性アミノ酸
アミド
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アスパラギン/Asparagine
(Asn/N)
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C4H8N2O3
|
132.12
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グルタミン/Glutamine
(Gln/Q)
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C5H10N2O3
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146.15
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酸性アミノ酸
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アスパラギン酸/
Aspartic acid (Asp/D)
|
C4H7NO4
|
133.10
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グルタミン酸/
Glutamic acid (Glu/E)
|
C5H9NO4
|
147.13
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塩基性
アミノ酸
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リジン/Lysine
(Lys/K)
|
C6H14N2O2
|
146.19
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ヒスチジン/Histidine
(His/H)
|
C6H9N3O2
|
155.16
|
アルギニン/Arginine
(Arg/R)
|
C6H14N4O2
|
174.20
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http://www.forestwalking.com/mwprotein.html
より転載
