I didn't mean it. 「そんなつもりじゃなかった」

「I didn't mean it.」
は、もっともよく使われるお決まりのフレーズです。

「I'm sorry.」の後に続けて、「I didn't  mean it.」と
２つで１セットのように使われることが多く、
相手が勝手に誤解して怒ってしまった場合や、
売り言葉に買い言葉で誤解する余地もないような
ひどいことを言ってしまった場合にも使えます。

この場合、

「つい言ってしまったけど、
本当はそんなふうに思ってるわけじゃないから…。
ごめんね」

という意味になります。