データは2014年に収集したデータに基づいております。
2016年現在朱印をされていない寺社も有る可能性があります。
逆に朱印を始められた、復活された寺社も有る可能性があります。
また、歯抜けもあるかと思いますので情報をお持ちの方はコメントよろしくお願いします。
（単純な記載漏れもあるかもしれません）
※予告なく追加、修正などする可能性がありますのでご了承下さい。
【東山区の朱印が頂ける神社一覧】
・粟田神社
・安井金比羅宮（安井のこんぴらさん）
・京都ゑびす神社
・京都霊山護国神社
・剣神社
・三嶋神社
・若宮八幡宮社（陶器神社）
・新熊野神社
・新日吉神宮
・大将軍神社（東三條大将軍神社）
・瀧尾神社
・地主神社（えんむすびの神さま）
・八坂神社（祇園社）
・豊國神社
・霊明神社
・高台天神（高台寺境内）
【東山区の朱印が頂ける神社一覧】
・安祥院
・雲龍院
・観音寺（今熊野観音寺）
・金剛寺（八坂庚申堂）
・建仁寺
┗ 正伝永源院 建仁寺塔頭
┗ 禅居庵 建仁寺塔頭
┗ 大統院 建仁寺塔頭
┗ 両足院 建仁寺塔頭
・香雪院（東山聖天）
・高台寿聖禅寺（高台寺・蒔絵の寺）
┗ 圓徳院 高台寺塔頭
・根来寺（智積院）
・実報寺
・寿延寺
・新善光寺
・正林寺
・清水寺
・西福寺（子育地蔵）
・青龍寺
・青蓮院
┗ 尊勝院
・泉涌寺（御寺）
┗ 即成院 泉涌寺塔頭
┗ 戒光寺（丈六さん） 泉涌寺塔頭
┗ 悲田院 泉涌寺塔頭
┗ 法音院 泉涌寺塔頭
┗ 来迎院
・大雲院（銅閣寺・祇園閣）
・大谷寺（知恩院）
┗ 崇泰院 知恩院塔頭
・仲源寺（目疾地蔵）
・長楽寺
・鳥辺山妙見堂
・通妙寺
・東景寺
・東福寺
┗ 一華院 東福寺塔頭
┗ 勝林寺 東福寺塔頭（東福寺の毘沙門天）
┗ 即宗院 東福寺塔頭
┗ 天得院 東福寺塔頭
┗ 同聚院 東福寺塔頭（じゅうまん不動さん）
┗ 龍吟庵 東福寺塔頭
┗ 霊雲院 東福寺塔頭
┗ 芬陀院 東福寺塔頭
・得浄明院
・日體寺
・寶徳寺（宝徳寺）
・方広寺
・法観寺
・法住寺
・法性寺
・本寿寺
・妙法院
・明暗寺
・養源院
・隆彦院
・霊山観音
・霊山興正寺別院
・蓮華王院本堂（三十三間堂）
・六道珍皇寺
・六波羅蜜寺（六はらさん）
・雙林寺
・寶樹寺