名探偵･石神法全の事務所を引き継いだ"僕"の所に猫のｼﾞｬﾝﾇを連れた狩野俊介少年が弟子入りした翌日､町で最大の豊川病院･寛治院長が来所して曰く｢妻の信子が怪しげな導師を自宅に泊めて､妙な宗教に凝り固まっているので､家に来て彼女の迷夢を醒まして欲しい｣早速､僕と俊介君とｼﾞｬﾝﾇはその豪邸に赴いた。そして､導師が午前零時に庭内にある庵､月光亭において奇跡を見せると言うので家族が集まったが､肝心の信子の姿が見えない。その時､突如停電となって･･･｡事件の幕が開いて"僕たちの"活躍が始まる。
ﾛﾝﾄﾞﾝのﾋﾞｯｸﾞﾍﾞﾝを象った大時計の完成式典で､針が12時を指した時､仕掛け人形の変わりに死体が飛び出した。死んでいたのは奇矯な行動で知られる時計作家。出馬を要請された作家探偵･霞田志郎の苦悩を嘲笑うかのように､さらに殺人は続いた。地元有力者･高野の屋敷で､巨大な砂時計の中から孫娘のあずみの死体が発見されたのだ゜。やがて､事件の背後に横たわる巨大な悪意に気づいた志郎は･･･。
1938年11月､ﾅﾁｽによるﾕﾀﾞﾔ人襲撃は､散乱する窓ｶﾞﾗｽの燦きに因み"水晶の夜"と名付けられた。その弾圧の象徴となった悪夢の夜が現代日本に蘇った。中京財界の重鎮ﾄﾏｽ工業元会長･宮谷巌の刺殺死体が､なぜか無数のｶﾞﾗｽ片に覆われていたのだ。さらに生前""ﾍﾞﾙﾘﾝの水晶""と呼んでいた守り袋も消失し､事件を追う作家探偵･霞田志郎は､宮谷の渡独仲間･片桐を訪ねるが･･･。
｢私は人形に殺される」謎の言葉を残し､新進人形作家の沖村がﾊﾟﾘで首吊り自殺した。現場では､赤いﾄﾞﾚｽの人形が階段を昇る姿を目撃されていた。三年後､奇怪な事件は日本で復活した。沖村の伝記出版記念会の夜､作家の牧が殺され､血染めのﾅｲﾌを持った沖村作の人形が発見されたのだ。二人の同級生で探偵作家の霞田志郎は､高校時代の追憶の中で真相を追う。だが､殺人者の次の標的は霞田本人だった。
臨海副都心に立つ大天使ﾐｶｴﾙ像は､ﾆｭｰﾖｰｸの女神像に匹敵する偉容を誇っていた。ある夜､直下のﾃｰﾏﾊﾟｰｸで男が絞殺された。｢汝､悪の創造者よ｣現場に残された英国詩人ﾐﾙﾄﾝ｢失楽園｣の詩句に、作家探偵･霞田志郎は犯人の秘密を看破するが･･･。同日､天才装丁家･浅井邸でも密室殺人が発生。死体を発見したのは志郎の妹千鶴は､なぜか､混濁する意識下で悪魔と天使の幻影を見た。二つの事件を結ぶ｢天使の秘密｣は何か?
｢姉を､助けて｣新進作家･霞田志郎は､ﾌｧﾝの女子高生･水沢美智子に､失踪した姉･圭子の捜索を依頼された。姉妹の父･正一は､中国陶磁器蒐集で知られ､悲劇の武将･岳飛愛用の""上海香炉""が自慢だった。志郎が水沢家を訪れた夜。香炉の飾られた寝室で､正一の愛人で美人ﾀﾚﾝﾄ･高岡聖子が殺された。失踪と殺人。この二つの事件に関連はあるのか?志郎は妹･千鶴と謎に迫るが、やがて第二の殺人が・・・。
ﾎﾃﾙでｳｨｰﾝ菓子を味わいながらﾓｰﾂｧﾙﾄを楽しむｼｮｰの最中､不可解な殺人が発生した。密室でﾋﾟｱﾆｽﾄ･倉坂杏が絞殺され､現場では､｢美しき青きﾄﾞﾅｳ｣の旋律が流れていたのだ。杏がｳｨｰﾝで買い求めた愛用のｵﾙｺﾞｰﾙだったが､同時に入手した二つが紛失していることも判明した。犯人が死体の横でｵﾙｺﾞｰﾙを鳴らした目的は?残る二つの行方と事件の関係は?真相を追う作家探偵･霞田志郎の許に第二の殺人の急報が・・・。
<謎の原稿｢さよならの殺人｣が､私を過去へ引き戻した･･･>1980年11月最後の日曜日､大学自治会長･森山が殺された。顔面を潰され､背中には｢天誅｣の張り紙が。すでに遺物と化した学生運動の内ｹﾞﾊﾞなのか?死体を発見した工学部四年の矢部は､動揺しつつも､敢然と事件を追い始めた。だが､ｼﾞｮﾝﾚﾉﾝ銃殺が伝えられるた夜､゜またしても殺人が･･･｡やがて､浮上する意外な真相!十七年の時を経て逆転する､もう一つの真実があった。
闇と光の交錯する混沌都市･新宿にそびえ立つ超高層ﾋﾞﾙ。ﾊｲﾃｸに支配されたその摩天楼には､連続殺人を謀る邪悪な意志が潜んでいた。現代文明の作った巨大に棺桶の中で､異能の中学生四人組が未知の科学力を武器に､見えない敵に戦いを挑む!
僕が5歳の時信州の別荘で起こった忌まわしい事件は､僕自身の記憶と両親を奪い去った。それから10年。僕の｢事件の記憶｣を取り戻し､｢事件の真実｣に迫ろうとする男が現れ､そして殺された。僕は目撃者､加害者､探偵。僕はﾄﾘｯｸ、さらに記録者。でも僕は誰?