ホメオストレッチを始めるとまず、
中脳が活性化される（第27回日本神経科学大会）。
中脳は、間脳の下部にあって、
なめらかな動きを可能にする重要な中継所を含むほか、
対光反射、視聴覚の中継所、眼球運動反射、
姿勢反射の活動調整を行っている。
中脳には、A10神経という精神性に関わる神経がある。
ドーパミン系神経、報酬系神経とも呼ばれ、
中脳の腹側被蓋野から出て、
怒り・恐怖などの感情の制御に関わる扁桃体や、
記憶に深く関わる海馬、欲求の実現に向け
指令を出す側坐核、大脳辺縁系を経て、
高度な精神活動や創造の働きに重要な前頭連合野と、
記憶・学習を総合する側頭葉へ入って終わる。
ホメオストレッチは、報酬系の活動を活発化させ、
意欲やひらめき、気づきを生み出して総合的な人間力を高めていく。