ジョン・エドガー・フーヴァー（John Edgar Hoover, 1895年1月1日 - 1972年5月2日）は、アメリカ連邦捜査局（FBI）の初代長官である。
ワシントンD.C.生まれと自称していたらしいが、生い立ちの詳細はほとんど知られていない謎の人物。出生証明書は1938年までファイルされなかった。よく知られる初期のプロフィールは、ジャーナリストのジャック・アレグサンダーが1937年にニューヨーカー・マガジンに執筆した物による。
高校卒業後、アメリカ議会図書館で働きながら夜間にジョージ・ワシントン大学で法律を学び、司法試験に合格した。学生時代に「カッパ・アルファ・オーダー」のメンバーとなった。 1924年5月10日にFBI長官に任命され、1972年に亡くなるまで長官職にとどまった。就任当時のカルビン・クーリッジからリチャード・ニクソンまで、8代の大統領に仕え、現在に至るまで合衆国で、最も長く政府機関の長を務めた人物である。なお以後のFBI長官任期は、10年に制限されている。
FBIを大きな影響力を持つ組織へと創り上げた点で称賛されるが、一方で自らの権威を盾に、有名人に対する諜報活動や恐喝に加え、政治的迫害を行ったことを始め、（晩年の時点で）その巨大すぎる権力行使は、大きな非難を受けていた。俗称ミスター・アンタッチャブル。
司法省からFBIへ
大学卒業後、司法省に入省し、在留敵国人登録課長としてその有能さをすぐに証明した。1919年に司法省の新しい諜報部門の長となった（組織犯罪パーマー襲撃）。1921年には捜査局副長官、1924年に長官に就任した。1966年にFBI長官としての功績に対し栄誉賞を受賞した。
フーヴァーが捜査局長官に就任したとき、441人の特別捜査官を含むおよそ650人の職員が在籍していた。彼はそれまで予算も少なく腐敗した弱小官庁だったFBIの組織改革に意欲的に取り組んだ。職員の私生活を調査し、不倫・同性愛・借金、さらには体重などを理由に次々に職員を解雇していった。代わりにアメリカ全土から優秀な警察官を採用した。ただ、フーヴァーは人種差別主義者であり、当時のFBI捜査官に有色人種をほとんど起用しなかった。捜査局は1935年に連邦捜査局として変革改名され、1939年にはFBIが国内の諜報分野で卓越した能力を持つことになった。彼がいつも気にしていたにはその検挙率であり、常に数字を気にする小心者でもあった。
Official and Confidential（公式かつ機密）
フーヴァーは人々の情報、特にFBIの記録とは別に非公式に政治家達の情報を収集してファイルに収録することでその影響力を蓄えていった。アメリカ大統領を筆頭にした政権の閣僚のスキャンダルも収録していたので、大統領さえも彼に手を出せなかった。『大統領たちが恐れた男』の原題であるOfficial and Confidential（公式かつ機密）は、フーヴァーが収録したファイルの名前を元にしている。「フーヴァー・ファイル Files of J. Edgar Hoover」には、有名人に対する恐喝や政治的迫害が記録されている。
リンドン・ジョンソン大統領は、自分が上院議員だった頃の電話を盗聴したのかフーヴァーに何度もしつこく電話で尋ねているし、（ジョンソンはフーバーの隣に住んでいた）。ケネディ大統領は、海軍に勤務していた20歳当時、女性との性的な関係を実際に盗聴されてしまった。
政治家からの追及
1960年代の始め、上院議員のエドワード・ロングは聴聞会を開き、FBIの盗聴を追及した。フーバーはこれに激怒し、彼に命じられた側近とFBI捜査官の二人が、ロングのスキャンダルをいくつか収録した「公式かつ機密」ファイルを本人に見せに行った。以後、ロングの追及は尻すぼみになり、以降、彼の政治的活動は終焉を迎える。
ジョン・F・ケネディもフーヴァーを免職しようとした。フーヴァーはすぐにケネディのもとに行き、もし免職したら自分が持っている情報（ケネディの弱点である女性問題や、マリリン・モンロー、自らも親しいサム・ジアンカーナなどの組織犯罪との関係）を公開すると言い放った。弟ロバート・ケネディが司法長官として立ち塞がりFBIを厳しく締め上げたとき、フーヴァーの片腕のクライド・トルソンは「誰かが奴を撃ち殺してくれればいいのに」と言い残している。 FBIはケネディ暗殺時、シンジケートとCIAの組織した暗殺実行部隊を市警からガードし、（本来大統領暗殺は市警の統括）ヒットマンを現場から逃がし、捜査権をムリヤリ市警から奪い取る行動を示した。 その証拠に当初ダラス市警のセイモア・ワイズマン巡査がTSBDの6Fで証拠物件であるモーゼル狙撃銃とバレット3発を押収したが、24時間後、そのニュースはぴたりと止まり、イタリア製狙撃ライフル、マンリカ・カルカーノが暗殺使用ライフルであるとFBIからアナウンスされた。 セイモア巡査は銃の専門家であり自説を曲げず、その後、FBI直轄の精神病院に強制的に入退院を繰り返され、最後には自殺している。
1972年、フーヴァーの死の直後、フーバーから見れば弟分のリチャード・ニクソン大統領が部下に命じてフーヴァーの書斎を調査させた。その「遺産」の内容を見たニクソンは激怒したと言われている。フーヴァーの死後、秘書のヘレン・ギャンディが非公式の「遺産」を処分するのに数日を費やした。昼夜を分かたず、現職大統領とその秘書が元FBI長官の庭で秘密書簡類を燃やす鬼気迫る光景.......これで、アメリカの真実の大半が失われて行ったのである。当時ニクソンはウォーター・ゲート事件、ベトナム戦争で追い詰められており、部下から100万ドルの恐喝を受け、なおかつ、自身の発言記録「ホワイト・ハウス・テープ」の削除に躍起になっており、「狂人」状態だったいう。
組織犯罪との関係
競馬など賭博好きのフーヴァーは、当時勢力を強めていたこともあり、存在感とともに非難が高まっていたものの、賭博に強い影響力を持っていたフランク・コステロやサム・ジアンカーナ、メイヤー・ランスキー、ジョニー・ロゼリなどの組織犯罪・シンジケートの存在すら認めず、「FBIの管轄外である」として強い態度に出ることはなかった。要は検挙率の低下を嫌がったのであり。司法長官として君臨したロバート・ケネディに対する反発もあった。決定的なことには組織犯罪から収賄があったことである。
私生活
フーヴァーは強烈なソドミィ（男色）であり、服装倒錯者だったというのは有名である。キューバがまだ革命前などには良くメイヤー・ランスキーやサントス・トラフィカンテの招きに応じ、毎夜少年を抱き、貪ったという。
フーヴァーはFBIのアシスタント・ディレクターであったクライド・トルソンと40年以上の付き合いがあり、彼らはしばしば共に休暇を取り、毎日昼食を共にとっていた。トルソンとの関係を証明する写真を組織が所有していたという。また、彼らは両方とも生涯独身であり、フーヴァーは1938年に母親が亡くなるまで同居していた。
