はっきりと調べられませんでしたが
日本赤十字と中央共同募金以外は手数料がかかってしまうようです

広範囲のためなど、振り分けについて時間がかかってますし
直接、災害対策本部宛てがよりスピーディかもしれません。

岩手県
http://pref-iwate-main.cloudapp.net/view.rbz?cd=31359
ゆうちょ銀行 00100-2-552 岩手県災害義援金募集委員会
岩手銀行 県庁支店 普通預金 2016634
北日本銀行 本店営業部 普通預金 3237416 3237413
東北銀行 本店営業部 普通預金 3237413

宮城県
http://www.pref.miyagi.jp/kihu.htm#3
ゆうちょ銀行 00170-0-526 宮城県災害対策本部
七十七銀行 県庁支店 普通預金 5515581 宮城県災害対策本部
仙台銀行 本店 普通預金 6979251 宮城県災害対策本部

福島県

http://wwwcms.pref.fukushima.jp/pcp_portal/PortalServlet?DISPLAY_ID=DIRECT&NEXT_DISPLAY_ID=U000004&CONTENTS_ID=23642
ゆうちょ銀行 00160-3-533 福島県災害対策本部
東邦銀行 県庁支店 普通預金 1411045 福島県災害対策本部
福島銀行 本店営業部 普通預金 1247821 福島県災害対策本部
大東銀行 福島支店 普通預金 1470102 福島県災害対策本部


日本政府を通じた東日本大震災義援金受付のご案内

http://www.cao.go.jp/gienkin/




日本赤十字・東北関東大震災義援金
http://www.jrc.or.jp/contribute/help/l4/Vcms4_00002074.html
郵便振替:00140-8-507 日本赤十字社 東北関東大震災義援金
※通信欄にお名前、ご住所、お電話番号を記載してください。
ゆうちょ銀行 支店:019店 当座預金 0000507  
三井住友銀行 銀座支店 普通預金 8047670
三菱東京UFJ銀行 東京公務部 普通預金 0028706 日本赤十字社

  
 
中央共同募金会・東北関東大震災義援金
http://www.akaihane.or.jp/er/index.html




他、ふるさと納税(=ふるさと寄附金)も1つの方法かと(クレジットカードで簡単にできます
また、こちら(ふるさと納税)の方が税の免除について詳しく説明されてます。

が、こっちの場合は個人に直接割り振られません

岩手県
http://www5.pref.iwate.jp/~hp0106/gaiyou/furusato_nouzei/index.html
宮城県
http://www.pref.miyagi.jp/zeimu/hurusato/hurusato-miyagi.html
福島県
http://www.pref.fukushima.jp/zeimu/furusato/furusatonouzei.htm


税の免除の目安について( ↓ ふるさと納税についての記載ですが、どの方法で募金を行ってもこのような税の優遇は受けられます)
PDF
http://www.pref.kagoshima.jp/__filemst__/52001/kifugakumeyasuh22.pdf
EXEL
http://www.pref.kumamoto.jp/uploaded/life/1010430_1017149_misc.xls