データは2022年8月1日までのものです。
(他の県もやって最終的に足しあわせて日本の人口がどうなるか確かめるため)
もしかしたら閲覧時にさらに全盛期を迎えている市町村がある可能性があります。
・順番は自治体コード順から
・自治体の公式ホームページに地区レベルで推計していた場合、その地区ごとの人口最多を調べる
・一部編入、譲渡など細かいところは調べきれないので引き算で対応
Source: http://demography.blog.fc2.com
国勢調査、e-stat、Wikipedia、その他自治体のHP

長崎市
(長崎市
『長崎市 211,702人 1935年
旧小榊村 6,892人 2021年2月末
旧茂木町 14,020人 1955年
旧小ヶ倉村 10,810人 2001年2月末
旧土井首村 17,881人 2001年1月末
旧深堀村 8,718人 2001年1月末
旧日見村 9,225人 2001年1月末
旧東長崎町 38,926人 2013年2月末
旧三重村 20,188人 2020年2月末
旧式見村 8,515人 1955年
旧福田村 11,214人 2002年11月末
旧西浦上村 94,875人 2001年1月末』
合計452,966人
旧香焼町 8,936人 1960年
旧伊王島町 7,266人 1960年
旧高島町 20,938人 1960年
旧野母崎町
『旧野母村 5,983人 1950年
旧脇岬村 4,150人 1950年
旧樺島村 3,654人 1925年
旧高浜村の一部 3,452人 1950年』
合計17,239人
旧三和町 12,904人 1995年
旧琴海町 12,930人 2006年2月末
旧外海町 13,828人 1965年)
合計で547,007人
※引き算で求めた。
17,052-(5,983+4,150+3,467)=3,452
佐世保市
(佐世保市
『佐世保市 97,515人 1990年
旧相浦村 28,866人 2007年6月
旧日宇村 28,376人 1990年
旧宮村 5,663人 1955年
旧折尾瀬村 6,936人 1947年
旧早岐町 34,233人 2014年3月
旧江上村 10,332人 1946年
旧﨑針尾村 3,911人 1947年
旧日宇村 28,376人 1990年
旧佐世村 10,082人 1990年
旧中里村、皆瀬村 12,295人 1995年
旧大野村 19,738人 1995年
旧黒鳥村 2,371人 1950年
旧柚木村 6,677人 1947年』
合計295,371人
旧宇久町 11,684人 1955年
旧江迎町 18,032人 1955年
旧鹿町町 20,405人 1950年
旧小佐々町 16,058人 1960年
旧吉井町 12,874人 1947年
旧世知原町 11,986人 1960年)
合計で386,410人
島原市
(島原市
『島原市 41,074人 1947年
旧三会村 6,416人 1950年』
合計47,490人
旧有明町
『旧大三東村 8,596人 1947年
旧湯江村 6,511人 1947年』
合計15,107人)
合計で62,597人
諫早市
(諫早市
『旧諫早町 38,752人 2012年12月
旧小栗村 10,728人 2009年9月
旧小野村 6,285人 2005年4月
旧有喜村 5,961人 1920年
旧真津山村 27,931人 2011年6月
旧本野村 3,206人 1930年
旧長田村 6,001人 2005年4月』
合計98,864人
旧多々見町
『旧喜々津村 13,856人 2005年12月
旧大草村 1,766人 1950年
旧伊木力村 2,413人 1950年』
合計18,035人
旧森山町 7,836人 1947年
旧飯盛町
『旧江ノ浦村 7,139人 1950年
旧田結村 3,075人 1946年』
合計10,214人
旧高来町
『旧深海村 2,652人 1947年
旧小江村 3,144人 1950年
旧湯江町 7,788人 1947年』
合計13,584人
旧小長井町 8,509人 1955年)
合計で157,042人
大村市
(旧大村町 27,846人 2022年8月
旧三浦村 2,961人 2022年8月
旧鉾田村 3,054人 2016年4月
旧西大村 30,805人 2016年4月
旧萱瀬村 2,580人 1930年
旧竹松村 24,298人 2022年8月
旧福重村 4,484人 2022年8月
旧松原村 2,391人 1935年)
合計で98,419人
平戸市
(平戸市 43,302人 1955年
旧大島村 5,658人 1920年
旧生月町 11,506人 1960年
旧田平町 10,872人 1955年)
合計で71,338人
松浦市
(松浦市 44,057人 1960年
旧福島町 11,648人 1955年
旧鷹島町 5,627人 1955年)
合計で61,332人
対馬市
(旧厳原町 23,472人 1960年
旧美津島町 12,812人 1960年
旧豊玉町 7,950人 1960年
旧峰町 6,032人 1960年
旧上県町 8,547人 1960年
旧上対馬町 11,062人 1955年)
合計で69,875人
壱岐市
(旧郷ノ浦町 19,612人 1955年
旧勝本町
『旧勝本町 8,181人 1950年
旧鯨伏村 3,088人 1947年』
合計11,269人
旧芦辺町
『旧芦辺町 10,352人 1955年
旧箱崎村 5,234人 1955年』
合計15,586人
旧石田町 6,184人 1955年)
合計で52,651人
五島市
(旧福江市
『旧福江町 33,220人 1955年
旧久賀島村 3,968人 1950年
旧樺嶋村 3,311人 1950年』
合計40,499人
旧富江町 15,112人 1955年
旧玉之浦町 9,829人 1935年
旧三井楽町 10,321人 1955年
旧岐宿町 10,021人 1950年
旧奈留町 9,268人 1960年)
合計で95,050人
西海市
(旧西海町
『旧瀬川村 6,538人 1955年
旧面高村 4,345人 1950年
旧七釜村 3,319人 1947年』
合計14,202人
旧西彼町 11,933人 1965年
旧大島町 18,373人 1960年
旧崎戸町
『旧崎戸町 22,723人 1950年
旧江島村 1,325人 1947年
旧平島村 1,609人 1950年』
合計25,657人
旧大瀬戸町
『旧多以良村 1,841人 1947年
旧瀬戸町 6,907人 1950年
旧松島村 13,287人 1920年
旧雪浦村 3,168人 1947年』
合計25,203人)
合計で95,368人
雲仙市
(旧国見町
『旧多比良町 6,148人 1947年
旧土黒村 4,538人 1947年
旧神代村 5,956人 1947年』
合計16,642人
旧瑞穂町
『旧西郷村 5,316人 1947年
旧大正村 3,425人 1947年』
合計8,741人
旧吾妻町
『旧守山村 4,196人 1947年
旧山田村 7,427人 1947年』
合計11,623人
旧愛野町 5,673人 2015年
旧千々石町 9,440人 1947年
旧小浜町
『旧小浜町 14,104人 1947年
旧北串山村 4,754人 1947年』
合計18,858人
旧南串山町 8,055人 1947年)
合計で79,032人
南島原市
(旧加津佐町 12,513人 1947年
旧口之津町 10,915人 1947年
旧南有馬町 11,330人 1947年
旧北有馬町 8,517人 1947年
旧西有家町 14,271人 1947年
旧有家町
『旧有家町 9,848人 1947年
旧堂崎村 5,539人 1947年』
合計15,387人
旧布津町 8,083人 1947年
旧深江町 10,239人 1947年)
合計で91,255人
長与町 42,728人 2012年12月
時津町 30,133人 2014年6月
東彼杵町
(旧千綿村 6,830人 1947年
旧彼杵町 7,483人 1947年)
合計で14,313人
川棚町 16,096人 1947年
波佐見町
(旧下波佐見村 5,580人 1950年
旧上波佐見町 10,525人 1955年)
合計で16,105人
小値賀町 10,968人 1950年
佐々町 20,166人 1950年
新上五島町
(旧若松町
『旧若松村 8,176人 1950年
旧日ノ島村 3,451人 1955年』
合計11,627人
旧上五島町
『旧浜ノ浦村 4,025人 1955年
旧青方町 8,003人 1955年』
合計12,028人
旧新魚目町 10,836人 1960年
旧有川町 13,280人 1960年
旧奈良尾町 10,790人 1950年)
合計で58,561人

全て合計すると、2,076,446人になり、長野県までの人口を追い抜き、16位に上がる。

市部計 1,867,376人
郡部計 209,070人

地方別
長崎地域 619,868人
県央地域 255,461人
島原地域 232,884人
県北地域 692,096人
五島地域 153,611人
壱岐地域 52,651人
対馬地域 69,875人