マーシーは実はブローネ皇帝の末っ子で、今まで末っ子とされていたアメシスの妹だった。という設定はどうでしょうか?
ゴーダ文明本星で、それを知ったブローネ皇帝は殺すつもりだったマーシーをどうしても手に入れたがる。
ブローネ皇帝の絶大な信頼をえているリキヤードは、マーシーの捕獲にはしる。
19代対18代のヤマト同士の対決。ブルーノアや第7艦隊も18代とともに戦う。
マーシーの力を使い最終兵器ゴーダプラズマ波動砲を19代ヤマトに打ち込む。
19代ヤマトは、ブローネ皇帝のいる宮殿のみ(さらばで白色彗星→都市が出てきたような形)