BEAST2のインプットファイル設定(subsitution modelのNormalize) | 今日から、俺は、遺伝子解析、始めます。

time clock modelでrelaxedを選ぶとNormalizeを選択することができる。

model comprisonを行う場合には、ここはチェックを入れて既知の置換率(Bacteriaであれば、1E-7~1E-8程度)を入れておいた方が良いらしい。

(ChatGPT)

実際のrunの時にはNormalizeしてはだめ。