dfast condaでインストールするとエラー出る問題

conda create -n dfast -c bioconda -c conda-forge -c defaults dfast

とかでまずdfastをインストール。

https://github.com/nigyta/dfast_core/blob/master/bin/Linux/blastp

https://github.com/nigyta/dfast_core/blob/master/bin/Linux/makeblastdb

https://github.com/nigyta/dfast_core/blob/master/bin/Linux/blastdbcmd

からblastp、makeblastdb、blastdbcmdをダウンロード。

~/anaconda3/envs/dfast/opt/dfast-xxx/bin/Linuxに上記3つをコピーする。

その後

~/anaconda3/envs/dfast/opt/dfast-xxx/db/protein

の中身を消去する。

最後に

dfast環境をactivateして

dfast_file_downloader.py --protein dfast

でデータベースの再構成を行う。