gffreadの使い方

今更感はあるが、gffreadなるものをcondaでインストールした。

gffファイルを利用した便利ソフト。想像しやすい事はたいていできるのでしょう。

gffread input.gff -g ref.fasta -x output_CDS.fasta

-xオプションでCDSがnuc配列に変換されたmaultifastaファイルが作成される。