ACT使っちゃうぞ！

ACT使い出すと結構便利。

databaseの作り方はいつも通り。

makeblastdbで比較されるreference sequenceのDBを作成。

次にこのDBを使ってsampleをlocal blast！

ここで-outfmt 6のオプションをつける。

blastn -db blastDB -query input.fasta 

-out blast_result.txt -outfmt 6

みたい感じです。

あとはACT起動！