Macで遺伝子解析始めるnow | 今日から、俺は、遺伝子解析、始めます。

今まではLinuxで解析を行ってきたが、ちょっと色々あってMacに乗り換えてみることにした。

手始めにMacbookProを購入。2018年モデルの15インチで、6core、32GB、SSD1Tで開始。

 

解析の注意点を書いていきます。

 

①sedコマンドの挙動がLinuxと違う!

解決のためにgnu-sedをインストール。brew install gnu-sedで簡単にインストール。

 

②.bash_profileが見当たらない。

自分で作るようだ。ホームディレクトリ下にviで作成。そこにパスを書いていく。

ただし、パスはexport PATH=/usr/local/bin:/usr/bin:/bin:/usr/sbin:/sbin:/usr/local/sbin

のように:区切りで一列で書かないと、変なパスが設定されてlsとかcdとか、binに入っているコマンドが使えなくなる。

 

③viエディタ

viコマンドでvimが立ち上がるが、設定が何もされていない。これもhomeディレクトリに設定ファイルを作成しないといけないようだ。

.vimrc作成して以下のように書き込む(あくまでこれは私の好み)

set number

set title

set showmatch

syntax on

set smartindent

set wrapscan