飛電インテリジェンスの新社長に就任した垓（桜木那智）は、ヒューマギアの強制停止、一斉リコールを発表。すべてのヒューマギアの人工知能データの消去を宣言する。一方、或人（高橋文哉）はデイブレイクタウンで迅（中川大輔）と接触。ヒューマギアを人間の支配から解放するという迅に、人間と同じようにヒューマギアの心を大切にしたいという自らの思いを訴え、協力を依頼する。そんな二人の前に、ザイアの指揮下に入ったエイムズの隊長・唯阿（井桁弘恵）が二人の部下を連れて現れた。エイムズ隊員はヒューマギアの迅を破壊すべくバトルレイダーに変身。迅もライダー迅に変身し迎え撃つ。そこへ唯阿の無線を傍受した諫（岡田龍太郎）が現れた。エイムズを辞めた諫は、アークを生み出しすべての元凶となったザイアを倒すために戦うと宣言。ランペイジバルカンに変身し、唯阿が変身したジャッカルレイダーに「目を覚ませ！」と圧倒すると、バトルレイダーを変身解除へと追い込む。変身を解除した諫は、或人に自分と唯阿の脳にチップが埋め込まれていることを告白。驚く或人に、諫は自分は操られたりしないと言うと、或人も諫同様ザイアと戦う決意を口にする。迅が飛電の本社から動きを停止したイズ（鶴嶋乃愛）とゼロワンドライバーのケースを手に或人の元にやってきた。或人は手元にあったイズのデータで再起動に成功。迅は復元したイズにアークの意志でも、ゼアの命令でもなく自分の自由意志で生きろと迫る。しかし、ゼアの命令に従ってきたイズは「私の仕事は社長秘書です」と拒絶。そんなイズに或人も迅と同じく「これからは君自身が決めるしかない」と訴え、迅を驚かせる。そんな３人の前にイズを破壊すべく、垓がザイアの隊員を伴い現れた。垓はイズの破壊を命令。ザイア隊員は容赦なくイズに向けて発砲するが、なんと或人が盾となりイズを庇う。すでに垓の命令でヒューマギアのデータはすべて消去、勝ち誇る垓だったが、唯阿から衛星ゼアにデータがないという連絡が入り愕然とする。実はすべてのヒューマギアのデータは、ジョブキーとして或人が所持。防弾チョッキのように身にまとい、マモルのジョブキーで或人は守られる。怒りも露わに垓はサウザーに変身。或人もゼロワンに変身しようとホッパーキーをドライバーにかざすが、社長でなくなった今、ドライバーは反応しない。やむなく或人は生身のままサウザーに立ち向かい、何度も跳ね返され傷だらけになる。或人を軽く受け流したサウザーはイズに強烈な一撃を放った。そこへ盾になった或人、壮絶な爆発と共にすべてが終わったかと思った次の瞬間、或人はゼロワンへの変身に成功する。ゼロワンはメタルクラスタホッパーにチェンジし、サウザーを撃破。すべては衛星ゼアが或人がゼロワンであることを認め、シンギュラリティに達したイズが、或人を社長とする新会社をインターネット上で設立したおかげだった。秘書のイズと「飛電製作所」を設立した或人。得意のダジャレとともに二人の新たな戦いが幕を開けようとしていた。
