選抜最多出場は、３年ぶり４１回目となった近畿地区の龍谷大平安（京都）。一般選考で選ばれた中で選抜初出場となったのは、北海道地区の札幌大谷、北信越地区の啓新（福井）、九州地区の筑陽学園（福岡）、大分（大分）、日章学園（宮崎）の５校。
また、横浜が激戦の「関東・東京」の６枠目に入り、５年ぶり１６回目の出場。史上初となる選抜３連覇と３季連続優勝が懸かっていた大阪桐蔭（大阪）は落選した。
２１世紀枠で出場するのは、石岡一（茨城）、富岡西（徳島）、熊本西（熊本）の３校。石岡一と富岡西は春夏通じて初、熊本西は８５年の夏以来２度目、春は初となる甲子園出場となった。
▽全出場校一覧【北海道地区】札幌大谷、札幌第一【東北地区】八戸学院光星（青森）、盛岡大付（岩手）【関東・東京地区】桐蔭学園（神奈川）、春日部共栄（埼玉）、習志野（千葉）、山梨学院（山梨）、国士舘（東京）、横浜（神奈川）【東海地区】東邦（愛知）、津田学園（三重）【北信越地区】星稜（石川）、啓新（福井）【近畿地区】龍谷大平安（京都）、明石商（兵庫）、履正社（大阪）、智弁和歌山（和歌山）、福知山成美（京都）、市和歌山（和歌山）【中国・四国地区】広陵（広島）、米子東（鳥取）、高松商（香川）、松山聖陵（愛媛）、呉（広島）【九州地区】筑陽学園（福岡）、明豊（大分）、大分（大分）、日章学園（宮崎）【２１世紀枠】石岡一（茨城）、富岡西（徳島）、熊本西（熊本）
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