スウォルツ（兼崎健太郎）が放った複数のアナザーアギトと戦う仮面ライダーアギト。しかし、援護に現れたツクヨミ（大幡しえり）が、オーラ（紺野彩夏）によって人質に取られてしまった。手を出せなくなったアギトは、ウール（板垣李光人）がかざしたウォッチによって力を吸い取られて翔一（賀集利樹）へと変身解除、アギトライドウォッチを作ってしまう。ウールはアギトウォッチでアナザーアギトをアギトに変えてしまう。勝ち誇るウールらタイムジャッカーはアギトとともに去っていくが、翔一を守るため再び時を止める力を使ってしまったツクヨミはショックを隠せず…。時を止める力を持つツクヨミとどう向き合うべきか？ ソウゴ（奥野壮）、ゲイツ（押田岳）、ウォズ（渡邊圭祐）は思い悩むが、翔一はそんな３人に「これからも一緒にいてあげればいい」とアドバイス。過去よりもソウゴらと進む未来の方が大切なのでは、と言う。ウールが操るアギト、アナザーアギトが街で暴れ始めた。ソウゴとゲイツは現場に急行すると、ジオウⅡ、ゲイツリバイブに変身。しかし、次々と数を増やすアナザーアギトにジオウらは苦戦を強いられる。翔一に勇気づけられ迷いを捨てたツクヨミがソウゴらと合流、さらにスウォルツからウールが倒しきれないほどのアナザーアギトを作り出すという情報を引き出したウォズも合流した。4人は気持ちも新たにウールと大量のアナザーアギトが待つ決戦場へと向かう！苦戦しながらも必死で戦うジオウⅡ、ゲイツリバイブ、ライダーウォズ。そこへG3も加勢するが、その正体は翔一だった。一瞬の隙をついて狙われる翔一を守ろうと、ツクヨミが時間を止めると、ゲイツリバイブとライダーウォズがアナザーアギトを撃破。ジオウⅡはアギトを攻撃し、アギトウォッチ奪還に成功する。ジオウらは合体しジオウトリニティにチェンジ、翔一もアギトに変身するとアギトトリニティにチェンジし、二人のトリニティは力を合わせアナザーアギト軍団を一気に粉砕する。翔一からアギトウォッチを受け取るソウゴ。ツクヨミにも笑顔が戻り、４人のチームはさらに結束を強めて新たな道へと進んでいく。そして今度は地響きのような太鼓の音が!?次回もお楽しみにね
