タイトルの通りなんですが、
症状にはいくつか違いがあるようで、私の場合はこの症状が出てはや半年くらいになります。最初にこの症状に出くわしたの…2012年9月頃だったかな(うろ覚え)?

◆環境
OS:Windows7(64bit)
ブラウザ:IE9(きつねとかは未確認)
フラッシュ:11(10世代でも症状は変わらなかった)
ニコ垢:プレミアム会員

◆症状
動画再生中に突然画面が緑になり、「ブッ」「ピッ」「プッ」などというノイズ音を伴ってシークバーが動画の最後まで一気に飛んでいく。
この時、動画再生画面下部のバー(シークバー)は白く塗りつぶされている(動画を読み込んだという意味で)。

1、ニコニコ動画で起きる(ようつべその他では確認できない)
2、動画の長さは関係ない(4分の動画だろうが30分の動画だろうが起こる)
3、フラッシュは10.3世代と11世代どちらでも同様の症状が起きている

◆解決策(みなさんも試してみてね!)
1、他のブラウザで視聴してみる(メンドーだがきつねとかオペラとか…)

   ↓これでダメなら…

2、画面上で右クリック→フラッシュの設定「ハードウェアアクセラレーション」のチェックボックスのチェックを外す

   ↓これでダメなら…

3、フラッシュを11.5にアップデートする

   ↓これでダメなら…

4、Windowsアップデートパッチで配布された「KB2735855」という更新プログラムをアンインストールしてみる(←今ここ検証中)

   ↓これでダメなら…

5、これでも症状が改善されない場合は、運営かAdobeかMSが解決してくれることを嘆願しましょうw

   ↓どうしてもみたい動画があるなら…

6、それまではマンドクセーけどこの方法が有効です(ブラウザIE9の人のみ)
  動画視聴中にこの症状が現れたら…
  a.ブラウザ上部のツール→インターネットオプションをクリック
  b.全般タブ→閲覧の履歴欄の「削除」をクリック
  c.「インターネット一時ファイル」のみチェックボックスにチェックが入っている状態で削除
  d.ブラウザの更新ボタンでページを再読み込み




完全に解決された方、いらっしゃればコメントお待ちしております^^