日本語の「マグロ」は目が大きく黒い魚であること（目黒 - まぐろ）に由来するという説がある。
他にも保存する事が困難とされた鮪は、常温に出しておくとすぐに黒くなってしまう為、まっくろ→まくろ→まぐろ。と言われるようになったと言う説も存在する。
現
代の日本語では、マグロ属の中の1種であるクロマグロ（学名：Thunnus
orientalis）のみを指して「マグロ」と呼ぶ場合も少なくない。また、「カジキマグロ」（カジキの俗称）および「イソマグロ」（イソマグロ属）は
和名に「マグロ」を含むが、学術上はマグロ（属）ではなく、生物学の成立以前から存在した通俗名（梶木鮪、磯鮪、など）を引き継いだものである。
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