クリアしてから上げられなかったアドベンチャーモードのクリア率を上げる方法がわかりました。
旗が立ってるステージにクリアしてない要素があるようです。

旗が完全クリアだと思い込んでいました。

それで気がついたのですが、フロアごとにクリア率が上がるみたいですね。

というわけで今やっと87%行きました。

まだまだやり尽くせそうにないです。
シンプルモードもまだまだクリアしてないキャラクターいるし、ホームラン競争もそんなにやりこんでないし。
それに、音楽の数が多くて、ちょっと聴いているだけであっという間に1時間くらい経ちます。アレンジがすごく上手いんですよ。

ある程度ゲームを堪能したら音楽にも耳を傾けてみてください。