ご存知の通りだとは思いますが、
飲食店でも許可が入りますし、不動産業も建設業も、運送業をするのにも許可が必要です。
私が多くお手伝いをすることがあるのが認可だとNPO
法人ですね。
他には
古物商（リサイクル）
宅建業
貸金業
宗教法人関連
農地関連
在留資格（VISA関係）
外国人就労システム
などですね。
これらは許可がないとどうにもならないものです。
一部一定の範囲内では許可なしでやることができるものもあるのですが、多くは許可なしでやったら違法になります。
場合によっては許可を受けられなくなることもありますので注意が必要です。
これから事業をしようという場合には気をつけてください。
場合によっては途中で取り消されることもありますので・・・・・