ニコニコ動画に投稿する演奏動画を作るためには、以下の素材が必要です。
1. 演奏音声ファイル（WAV形式が望ましいがMP3でも可）
2. 動画ファイル（MPEGで十分、余裕があればAVI形式かDV形式で）
そして、この二つの素材を合成して、一つの動画を作ります。そしてこの動画が、ニコニコ動画に投稿できるものになっていなくてはなりません。
ニコニコ動画に投稿できる動画の形式については、ニコニコ動画のまとめWiki に詳しく書いてありますから追及するならそちらを見ていろいろ試してみてください。
私がいろいろ試したところでは、とりあえず以下の二つの形式のファイルであれば投稿できるようです（プレミア会員限定かも）
・サイズが640x480で100MB以下のWindows Media Videoフォーマット形式
・サイズが512x384で40MB以下のH.264フォーマット形式
前者の場合、WindowsXP/Vista付属の『Windows ムービーメーカー』が手軽です。後者はAviUtilなどのソフトを自前で用意しなくてはならないので少し難易度が高いですが、前出のニコニコ動画のまとめWikiをよく読んで導入すれば大丈夫でしょう。
また、私はまだ手に入れていませんが、AdobeのAdove Premiere Elements 4は、動画の編集のみならず、ニコニコ動画やyoutubeで扱われている形式であるFLV形式（Flash Video）で出力できるそうです。これは便利そうなので私も近々買ってこようと思っています（；＾＾）ﾒﾝﾄﾞｸｻｲﾉｷﾗｲﾀﾞﾓﾝ
Windows ムービーメーカーやAviUtilの使い方については、前出のまとめWikiをご覧ください。詳しく書かれていますし、だいたい触ればなんとかできるようになっているソフトです。
さあ、これで準備は整いました。あとは実際に自分で演奏して、動画を撮って、ファイルを作り、ニコニコ動画にうｐするだけです！
。。。そのまえにギターの練習ですねｗ