四国、中国地方を通過した大型の台風１２号は４日未明、山陰沖の日本海に抜けた。紀伊半島は記録的な大雨となり、朝日新聞社が集計したところ４日夜までに和歌山、奈良、三重３県で計２０人が死亡、５１人が行方不明になっている。全国では計２４人が死亡、５４人が行方不明。台風の動きが遅く、５日も東日本や北海道で断続的に激しい雨が降る恐れがあり、気象庁は警戒を呼びかけている。被害規模は、９８人が死亡・行方不明になった２００４年１０月の台風２３号以来の大きさ。
同庁によると、４日までの３日間の累積雨量は、奈良県上北山村で１６５２ミリ、同県十津川村で１３０３ミリ、三重県大台町で１５１９ミリを記録。いずれも観測史上最大になった。和歌山県新宮市や三重県熊野市では４日明け方、１時間あたり１３０～１００ミリの猛烈な雨が降った。
紀伊半島では土砂災害や河川の氾濫（はんらん）が相次いだ。道路の寸断などで捜索・救助活動は難航しており、さらに被害が拡大する恐れがある。
平野達男防災相は４日夜、政府の非常災害対策本部の会議後に記者会見し、「紀伊半島では連絡が取れない場所もあると聞いている。まずは上空から確認することが第一段階。そういったことをやらないと、まだ（被害の）全貌（ぜんぼう）が明らかにならない部分がある」と述べた。
和歌山県警によると、同県では１５人が死亡、２８人が行方不明。同県によると、５日午前０時現在、田辺、新宮両市など４市町で約４７００人が孤立している。
同県那智勝浦町では住宅が土石流で流されるなどし、８人が死亡、１３人が行方不明。隣接する新宮市でも２人が死亡、６人が行方不明という。田辺市伏菟野（ふどの）地区では４日午前０時４０分ごろ、大規模な土砂崩れが起き、民家６軒が巻き込まれた。住人の山本正江さん（６９）が死亡、４人の行方がわからなくなっている。