若山氏は、アーティクル論文とレター論文では、幹細胞を樹立し、キメラマウス作製をしたと言いますが、実際に、誰が何をしたのかの実験内容についての責任体制は明らかにされていません。
小保方氏が実験を実際にやったのか？やっていないか？調査委員会は、実験実施の有無はわからず、データが無いので判断できないとしています。
しかし、実際の論文には実験データの記載が残っているのですから、誰かが実験をしてデータを取得しているはずです。理研は調べようと思えば、傍証的な事実からでも、調べられる立場にあります。証言を聞いたりもできる立場です。
しかし、調査委員会が調べるのはよろしくないと考えると、実験の実態は出てこないのですね。
実験ノートもかなりの部分が未公開とされています。
今回は、若干の疑問を皆さまに投げてみました。
何か、コメントありましたが、よろしくお願いいたします。
若山研究室でFI細胞実験が行われていた時、そこからGRASにサンプルを運んだ人は誰なのでしょうか？すでに実際のFI細胞実験が終了してから、理研の遺伝子解析担当者は、小保方氏らに再度、サンプルをGRASに提出をさせています。2012年8月、2013年1月および6月です。
しかし、実際の論文記載の実験が行われた時の遺伝子取得データの際には、小保方氏以外のの人が、GRASにサンプル提出していると想像します。
桂報告書の記載では
2012年8月に第1回目としてTS細胞とFI幹細胞のRNA-seq用サンプル(TS1とFI-SC1) 、2013年1月および6月に(TS 細胞 1 種類(TS2)および FI 幹細胞 2 種類(FI-SC2、FI-SC3)をGRASに提供したとありますので、これは実験中に得られたデータではありません。実験中には、若山研究室のスタッフが持ち込んでいるはずです。
2012年8月に第1回目としてTS細胞とFI幹細胞のRNA-seq用サンプル(TS1とFI-SC1) 、2013年1月および6月に(TS 細胞 1 種類(TS2)および FI 幹細胞 2 種類(FI-SC2、FI-SC3)をGRASに提供したとありますので、これは実験中に得られたデータではありません。実験中には、若山研究室のスタッフが持ち込んでいるはずです。
実験の状況は、論文にはどのように触れているのか？気になる点を、少し紹介します。
Methodsの最後の２項目「STAP stem cell convertion culture」と「Karyotype analysisに書かれている記載内容に注目しました。
論文の訳は青字で書きます。
STAP細胞塊からSTAP幹細胞を作り、このSTAP幹細胞を細いガラスピペットで吸い取って1個、１個の細胞にして培養して増殖させ、以後の実験に使った。
STAP幹細胞を１個のレベルまで単離して、以後１個の細胞から増殖させていきます。
この実験を以下の３種のマウスごとに行っています。
この実験を以下の３種のマウスごとに行っています。
Oct4-gfp を持つB6マウス
Rosa26-gfp を持つ129/Sv マウス
cag-gfp を持つ129/Sv×B6マウス
Rosa26-gfp を持つ129/Sv マウス
cag-gfp を持つ129/Sv×B6マウス
この実験では、細胞を１個１個のレベルで扱うためには、マニプレーターが必要でしょうから、この実験は小保方氏がやったものではないだろう？と考えます。
どなたか、ご意見あるでしょうか？
染色体検査のQバンド染色は、Chromocentre (Japan) で行ったとあります。
ここがどこなのわかりませんが、何か受託の検査研究所なのでしょうか？
ここにSTAP幹細胞を提出たところ、STAP幹細胞には、染色体異常は無いことが判明したとアーティクル論文に書かれていますので、ここは、どのようなところなのでしょうか？
問い合わせると何かわかるでしょうか？もちろん、一般人では無理でしょうが、桂委員会なら、実験担当者を確定するためにはやっても良い調査ではないでしょうか？
別の疑問提起です。
相澤論文でかかれていたマウスに関する疑問です。
相澤論文では、
相澤論文では、
①OCｔ入B6ホモと、
②Cag入りB6ホモとAC１２９の掛け合わせF1を、
細胞凝集実験に使っています。
キメラマウス作製では、
③CagホモB6（岡部マウス）と、
④Cag入りB6ホモとAC１２９の掛け合わせF1（Cagはヘテロ）
を使用しています。
CDBで維持されている岡部マウスは、Cagホモのマウスであるがアクロシン入りではなさそうです。
というのも、相澤氏らは、CDBで維持している岡部マウス（Ocｔホモ入りB6）を使用したとあるが、ネーチャー元論文に使われたマウスは、相澤論文で使われたマウスとは異なると言っています。
そして、ネーチャー元論文で使われたマウスは相澤氏にはわからず、若山氏の作製によるものかも？と言っています。
一方、日経サイエンスの記載では岡部マウスはCagとアクロシン入りと書かれています。
若山氏がいた時のCDBでは、アクロシン有りと無しの２種類の岡部マウスを、維持していたのでしょうか？
質問が難しい話題になってしまいましたが、いづれにしろ、今後、小保方氏によって、実験の実態が明らかになっていってほしいと思っています。