Xymonで、サーバやクライアントのインストールでにmakeする際にundefined reference to `clock_gettime’ とのエラーが出る場合、

Makefileを確認して、
# Large File Support settings
LFSDEF =
LIBRTDEF =
となっている場合、configureがうまく動いていない可能性があります。
Makefileを手動で下記に編集して、
# Large File Support settings
LFSDEF = -D_LARGEFILE_SOURCE -D_FILE_OFFSET_BITS=64
LIBRTDEF = -lrt
再度makeしてみてください。

Linux環境で確認しました。