詳細は「S&Mシリーズ 」を参照
- すべてがFになる The Perfect Insider 講談社ノベルス、1996
- 冷たい密室と博士たち Doctors in Isolated Room 講談社ノベルス、1996
- 笑わない数学者 Mathematical Goodbye 講談社ノベルス、1996
- 詩的私的ジャック Jack the Poetical Private 講談社ノベルス、1997
- 封印再度 Who Inside 講談社ノベルス、1997
- 幻惑の死と使途 Illusion Acts Like Magic 講談社ノベルス、1997
- 夏のレプリカ Replaceable Summer
- 今はもうない Switch Back
- 数奇にして模型 Numerical Models
- 有限と微小のパン The Perfect Outsider
Vシリーズ [編集 ]
詳細は「Vシリーズ (小説) 」を参照
- 黒猫の三角 Delta in the Darkness
- 人形式モナリザ Shape of Things Human
- 月は幽咽のデバイス The Sound Walks When the Moon Talks
- 夢・出逢い・魔性 You May Die in My Show
- 魔剣天翔 Cockpit on Knife Edge
- 恋恋蓮歩の演習 A Sea of Deceits
- 六人の超音波科学者 Six Supersonic Scientists
- 捩れ屋敷の利鈍 The Riddle in Torsional Nest（講談社ノベルス創刊20周年「密室本」の1冊でもある）
- 朽ちる散る落ちる Rot off and Drop away
- 赤緑黒白 Red Green Black and White
四季シリーズ [編集 ]
詳細は「真賀田四季#『四季』シリーズ 」を参照
- 四季 春 The Four Seasons Green Spring
- 四季 夏 The Four Seasons Red Summer
- 四季 秋 The Four Seasons White Autumn
- 四季 冬 The Four Seasons Black Winter
- 四季 The Four Seasons （『春』『夏』『秋』『冬』の合本）
Gシリーズ [編集 ]
詳細は「Gシリーズ (小説) 」を参照
- φは壊れたね Path connected φ broke
- θは遊んでくれたよ Another playmate θ
- τになるまで待って Please stay until τ
- εに誓って Swearing on solemn ε
- λに歯がない λ has no teeth
- ηなのに夢のよう Dreamily in spite of η
- 目薬αで殺菌します Disinfectant α for the eyes
- ジグβは神ですか Jig β knows Heaven
Xシリーズ [編集 ]
詳細は「Xシリーズ 」を参照
- イナイ×イナイ Peekaboo
- キラレ×キラレ Cutthroat
- タカイ×タカイ Crucifixion
短編集 [編集 ]
- まどろみ消去 Missing under the Mistletoe
- 地球儀のスライス A Slice of Terrestrial Globe
- 今夜はパラシュート博物館へ The Last Dive to Parachute Museum
- 虚空の逆マトリクス Inverse of Void Matrix
- レタス・フライ Lettuce Fry
- 僕は秋子に借りがある 森博嗣自選短編集 I'm in Debt to Akiko（上記の短編集の中から著者のお気に入りを抜粋）
- どちらかが魔女 森博嗣シリーズ短編集 Which is the Witch?（短編集の中からS&Mシリーズの短編を抜粋）
スカイ・クロラ シリーズ [編集 ]
詳細は「スカイ・クロラシリーズ 」を参照
- スカイ・クロラ The Sky Crawlers
- ナ・バ・テア None But Air
- ダウン・ツ・ヘヴン Down to Heaven
- フラッタ・リンツ・ライフ Flutter into Life
- クレィドゥ・ザ・スカイ Cradle the Sky
- スカイ・イクリプス Sky Eclipse
Mシリーズ [編集 ]
- 工学部・水柿助教授の日常 The Ordinary of Dr.Mizukaki 幻冬舎、2001
- 工学部・水柿助教授の逡巡 The Hesitation of Dr.Mizukaki
- 工学部・水柿助教授の解脱 The Nirvana of Dr.Mizukaki
Zシリーズ [編集 ]
- ZOKU
- ZOKUDAM
- ZOKURANGER 光文社、2009
百年シリーズ [編集 ]
詳細は「百年シリーズ 」を参照
- 女王の百年密室 God Save the Queen 幻冬舎
- 迷宮百年の睡魔 Labyrinth in Arm of Morpheus
ヴォイド・シェイパ シリーズ [編集 ]
- ヴォイド・シェイパ The Void Shaper
- ブラッド・スクーパ The Blood Scooper
- スカル・ブレーカ The Skull Breaker
シリーズ外の小説 [編集 ]
- そして二人だけになった Until Death Do Us Part 新潮社
- 墜ちていく僕たち Falling Ropewalkers 集英社
- 奥様はネットワーカ Wife at Network
- 探偵伯爵と僕 His name is Earl
- どきどきフェノメノン A phenomenon among students
- カクレカラクリ An Automaton in Long Sleep
- 少し変わった子あります Eccentric persons are in stock
- ゾラ・一撃・さようなら Zola with a blow and goodbye
- もえない incombustibles
- 銀河不動産の超越 Trancendence of Ginga Estate Agency
- トーマの心臓 Lost heart for Thoma - 原作／萩尾望都
- 喜嶋先生の静かな世界 The Silent World of Dr.Kishima
- 相田家のグッドバイ Running in the Blood
庭園鉄道関係 [編集 ]
- ミニチュア庭園鉄道 欠伸軽便鉄道弁天ヶ丘線の昼下がり
- ミニチュア庭園鉄道2 欠伸軽便鉄道弁天ヶ丘線の大躍進
- ミニチュア庭園鉄道3 欠伸軽便鉄道弁天ヶ丘線の野望
- 庭園鉄道趣味 鉄道に乗れる庭 Garden Railway Life
- 庭煙鉄道趣味 庭蒸気が走る毎日 Steam in the Garden
浮遊研究室シリーズ [編集 ]
- 森博嗣の浮遊研究室 MORI Hiroshi's Floating Laboratory
- 森博嗣の浮遊研究室2 未来編 MORI Hiroshi's Floating Laboratory 2
- 森博嗣の浮遊研究室3 宇宙編 MORI Hiroshi's Floating Laboratory 3
- 森博嗣の浮遊研究室4 鳳凰編 MORI Hiroshi's Floating Laboratory 4
- 森博嗣の浮遊研究室5 望郷編 MORI Hiroshi's Floating Laboratory 5
モリログシリーズ [編集 ]
2008年12月までWEBダ・ヴィンチ で連載したもの。
- MORI LOG ACADEMY 1 モリログ・アカデミィ 1
- MORI LOG ACADEMY 2 モリログ・アカデミィ 2 1年のケーキ元旦に飽き
- MORI LOG ACADEMY 3 モリログ・アカデミィ 3 日のないところに書け無理絶えず
- MORI LOG ACADEMY 4 モリログ・アカデミィ 4 投げたらあかん!
- MORI LOG ACADEMY 5 モリログ・アカデミィ 5 なんとなくクリスマス
- MORI LOG ACADEMY 6 モリログ・アカデミィ 6 指揮者必衰のおことわり
- MORI LOG ACADEMY 7 モリログ・アカデミィ 7 山伏の品格
- MORI LOG ACADEMY 8 モリログ・アカデミィ 8 レースにかける青春
- MORI LOG ACADEMY 9 モリログ・アカデミィ 9 おあとがよろしいようで
- MORI LOG ACADEMY 10 モリログ・アカデミィ 10 推定鼯鼠
- MORI LOG ACADEMY 11 モリログ・アカデミィ 11 飛行少年の日々
- MORI LOG ACADEMY 12 モリログ・アカデミィ 12 たそがれの天職
- MORI LOG ACADEMY 13 モリログ・アカデミィ 13 ウは宇宙のウ
日記シリーズ [編集 ]
- すべてがEになる I say Essay Everyday 幻冬舎
- 毎日は笑わない工学博士たち I say Essay Everyday 幻冬舎
- 封印サイトは詩的私的手記 I say Essay Everyday
- ウェブ日記レプリカの使途 I say Essay Everyday
- 数奇にして有限の良い終末を I say Essay Everyday
写真集、絵本、詩集 [編集 ]
- アイソパラメトリック Isoparametric 講談社
- 詩集 MATEKI - 魔的 Magical Words behind me
- 君の夢 僕の思考 You Will Dream While I Think
- 議論の余地しかない A Space under Discussion
- 的を射る言葉 Gathering the Pointed wits
- STAR EGG 星の玉子さま
- STAR SALAD 星の玉子さま2 文藝春秋
- 悪戯王子と猫の物語 Fables of Captain Trouble and Cat （ささきすばるとの共著）講談社
- 猫の建築家 A Cat of Architect （絵：佐久間真人 ）
- 蜥蜴 Salamander （ささきすばるとの共著）
- 蛟竜 Dragon （ささきすばるとの共著）
- DAY & NIGHT 昼も夜も （ささきすばるとの共著）
エッセィ・対談・ファンブック [編集 ]
- 工作少年の日々 Under Construction forever
- 森博嗣の TOOL BOX（文庫化にあたり『森博嗣の道具箱 The Spirits of Tools』と改題）
- 森博嗣の半熟セミナ 博士、質問があります！ DR. MORI's Soft-boiled Seminar
- 悠悠おもちゃライフ The Leisurely Life with Toys and Models
- 森博嗣のミステリィ工作室 Mori's Mystery Workshop メディアファクトリー
- 100人の森博嗣 100 MORI Hiroshies
- 人間は考えるFになる （土屋賢二 との共著）
- アンチ・ハウス ANTI HOUSE （阿竹克人 との共著）
- DOG & DOLL Tokyo FM出版, 2009.3.
- TRUCK & TROLL The Leisurely Life with Toys and Models
- つぶやきのクリーム The Cream of the notes
- 森博嗣本～作品ガイドからお庭まで～（別冊宝島 編集部・編） 西尾維新 との対談などが収録されているファンブック。絶版。